Jaarverslag_VSC_2020.pdf

VSC | Vlaams Supercomputer Centrum

Jaarverslag 2020 Met steun van

Inhoudsopgave Voorwoord

4

In de kijker

6

48

Subsidiëring

48

Effectieve personeelsinzet

49

Profielen

50

Hortense & Supercomputing as

Gevorderde ondersteuning

52

a Service

Outreach naar bedrijven

COVID-19 VSC User Council

53

Het VSC uitgelicht

8

COVID-19

53

VSC en het Tieringmodel

8

Testgebruikers

54

VSC Governance structuur

9

Bestaande en nieuwe klanten

55

Financiering van het VSC

10

Partnerships

56

Recurrente financiering

10

VSC Industriële raad

56

Eenmalige investering SaaS

11

Opleidingen

58

COVID-19

13

VSC in de media

62

De VSC Infrastructuur

14

Succesverhalen

64

Het Tier-1 supercomputerplatform

14

Activiteiten uitgevoerd in 2020

14

Toekennen van rekentijd

24

Exploitatiemodellen voor Tier-1 SaaS platform

28

Internationale samenwerking 76 PRACE/LUMI/EuroCC/EuroHPC

76

EGI

76

30

Bijlagen

78

Tier-2 infrastructuur per instelling

30

Exploitatie en gebruik

37

Colofon

86

Toekennen rekentijd Tier-2

42

Gebruikersondersteuning

44

Tier-2 infrastructuur

2

Personeel

Beantwoorden van vragen van gebruikers

44

Bijeenkomsten met gebruikers / specifieke ondersteunin

45

Jaarverslag 2020 | vscentrum.be

Jaarverslag 2020 | vscentrum.be

3

Voorwoord In 2020 kreeg de wereld te maken met COVID-19. Het VSC nam in maart al de beslissing om extra rekencapaciteit ter beschikking te stellen van onderzoekers voor specifiek COVID-19 onderzoek. Op die manier bevond VSC zich aan de frontlinie in de strijd tegen de pandemie, door de ondersteuning van onderzoek naar virusremmers, het berekenen van populatiemodellen, het effect van overheidsmaatregelen en meer. Impact op excellent onderzoek blijft in de VSC dienstverlening een belangrijke drijfveer. Zo verbreedde men verder de organisatiestructuur door middel van het opzetten van een nieuwe User Council. Elf leden uit verschillende Vlaamse onderzoeksinstellingen delen hun HPC ervaringen om de VSC werking verder te optimaliseren. Naar de industrie zijn opnieuw verschillende initiatieven gelanceerd. Meer bedrijven konden met het VSC aanbod aan de slag, en bestaande klanten maakten meer gebruik van de VSC dienstverlening. Recent opgezette samenwerkingen kregen meer vorm. Om alle gebruikers beter te kunnen bedienen, is in 2020 de aanbesteding voor een nieuwe Tier1 infrastructuur afgerond. Deze infrastructuur vindt in 2021 onderdak in het datacenter van de Universiteit Gent. Hortense, naar NicoleReine Lepaute - één van de eerste bekende menselijke computers, beschikt over een RAMgeheugen van bijna 100 TB, piekprestaties tot 3,3 petaflops, en GPU capaciteit.

data aan kennisinstellingen en bedrijven. Usegalaxy is een ander voorbeeld. Hier bouwde VIB een analyseportal met een gebruiksvriendelijke interface om onderzoekers in de levenswetenschappen in staat te stellen dataintensieve analyses uit te voeren zonder geavanceerde computerskills. Een eerste data project is opgezet samen met 5 onderzoeksgroepen van 3 universiteiten (UGent, VUB en KU Leuven) die klimaatveranderingsstudies uitvoeren. Het samenwerkingsproject gebruikt soortgelijke datasets, vergelijkbare workflows en softwaretools. Vanaf het moment dat de data op het platform staan, kan de gebruiker de data openen, beheren, doorzoeken en delen en die datasets gebruiken als inputdata voor simulaties op VSC Tier-1 Compute. Vanuit Europa verhoogt EuroHPC de aandacht voor HPC. België maakt deel uit van het LUMI consortium. Verder ging ook het nationaal HPC competentie centrum, onder leiding van Cenaero, van start met als doel HPC expertise verder te bundelen en impact van HPC op de samenleving te faciliteren.

Op het huidige Supercomputing-as-a-Service platform liepen een aantal succesvolle pilootprojecten. Zo ontwierp LifeWatch Belgium ‘Data Cloud voor Maritieme Industrie’ voor het snel en efficiënt beschikbaar maken van Belgische mariene (biodiversiteits)

4

Jaarverslag 2020 | vscentrum.be

Leen Van Rentergem | Jan Ooghe | Ingrid Barcena Roig

Annie Cuyt | Stefan Becuwe | Bert Tijskens

Johan Van Camp | Ewald Pauwels | Stijn De Weirdt

Stefan Weckx | Ward Poelmans

Geert Jan Bex | Rafal Al-Tekreeti

Caroline Volckaert | Tim Jaenen

Jaarverslag 2020 | vscentrum.be

5

In de Kijker SAAS

VSC User Council

COVID-19

Om de gebruikersbelangen binnen het brede Vlaamse onderzoekslandschap te behartigen, ging het VSC over tot een nieuwe inrichting van de User Council. Bij de samenstelling werd rekening gehouden met de concrete ervaring met HPC in de verschillende aspecten (compute, cloud, data/nationaal, EU/niet-EU, …), en werd er op gelet dat verschillende aspecten uit het werkveld, en wetenschappelijke domeinen aan bod komen.

In maart opende VSC een speciale COVID-19 oproep voor academisch en industrieel onderzoek. VSC wilde als HPC-centrum de inspanningen ondersteunen om de pandemie te bestrijden door op een eenvoudige manier toegang tot supercompute resources op de VSC HPCinfrastructuur te verlenen.

9

Hortense & Supercomputing as a Service

13

In 2020 werden de details voor de nieuwe Tier-1 Compute component bekendgemaakt. In totaal bevat deze cluster meer dan 44.000 CPUcores, 80 GPUs en bijna 100 TB aan RAM. Daarmee wordt dit de grootste en snelste supercomputer van Vlaanderen, met een geschatte piekperformantie van 3.3 petaflops. Als naam werd gekozen voor Hortense. Dat is een verwijzing naar Nicole-Reine Lepaute. Zij was één van de eerste notoire menselijke computers (‘calculatrice’), die verscheidene zware astronomische berekeningen uitvoerde. De Tier-1 data en cloud componenten werden verder uitgebouwd met een focus op verschillende piloot projecten.

16

6

Jaarverslag 2020 | vscentrum.be

Wat we waarderen aan VSC is de kwaliteit van de infrastructuur en de kwaliteit van de technische ondersteuning die we krijgen. Het VSC fungeert als een katalysator om imec-innovaties binnen zijn ecosysteem te ondersteunen.” Geoffrey Pourtois* Fellow |

*bekijk zijn succesverhaal op pagina 75 Jaarverslag 2020 | vscentrum.be

7

Het VSC uitgelicht VSC en het Tieringmodel De ondersteuning en uitbating van High Performance Computing (HPC) is in Vlaanderen georganiseerd binnen het Vlaams Supercomputing Centrum, het VSC. Het VSC is een consortium waarin de 5 Vlaamse associaties de krachten bundelen om HPC-infrastructuur en ondersteuning aan te bieden aan de brede onderzoeksgemeenschap in Vlaanderen, zowel uit universiteiten, kennisinstellingen, bedrijven en overheid. Daarnaast biedt het VSC binnen haar opdracht als dienstverlener een waaier aan opleidingen aan die het gebruik van de infrastructuur moeten bevorderen. Het huisvest infrastructuur in vier hubs: UAntwerpen, Vrije Universiteit Brussel, UGent en KU Leuven. Het VSC wordt beheerd door het FWO, Fonds Wetenschappelijk Onderzoek - Vlaanderen.

Tier 0 Tier

1

Tier 2

Vlaams Supercomputer Centrum

Tier 3

Afbeelding 1. Tiering model

In het Europees model voor HPC wordt een onderscheid gemaakt tussen drie niveaus: de rekencapaciteit waarover onderzoeksinstellingen beschikken (Tier-2), de rekencapaciteit waarvan de noden en de kosten een instelling overstijgen en die op het niveau van een regio of een land voorzien wordt (Tier-1) en de superzware rekeninfrastructuur (Tier-0). Het VSC richt zich vooral op de lagen Tier-2 en Tier-1, en poogt zo een getrapte brug te vormen tussen Tier-3 en Tier-0.

8

Jaarverslag 2020 | vscentrum.be

VSC Governance structuur Sedert 2019 werd de governance-structuur van het VSC grondig hertekend, wat gepaard ging met een duidelijkere inbreng van meerdere stakeholders: kennisinstellingen, de Vlaamse wetenschappelijke instellingen (VWI’s), de strategische onderzoekscentra (SOC’s), en de industrie. Een High-End Computing (HEC) raad – Vlaanderen stuurt de werking aan, stippelt het langetermijnbeleid voor het VSC uit en definieert een aantal strategische doelstellingen. Voor de komende jaren zullen de noden van de (toekomstige) gebruikers (compute, cloud, data en nieuwe disciplines) immers bepalend zijn voor de toekomst en de rol van het VSC. De positionering t.o.v. EuroHPC zal hierbij ook een rol spelen. Een langetermijnfinanciering dient dan ook verder bepleit te worden. Een operationeel team zorgt o.m. voor een duurzame ondersteuning van gebruikers (advies en training), ook vanuit de industrie; samenstelling/architectuur van Tier-2 systemen; mogelijkheden voor federatie, expertise bundeling, training en specialisatie; uitwisseling van cycles voor een bepaalde omvang tussen de Tier-2 systemen. De VSC Industriële raad ontwikkelt initiatieven om bedrijven en non-profit instellingen te informeren over de toegevoegde waarde die HPC levert bij het ontwikkelen en optimaliseren van diensten en producten en promoot de diensten die het VSC aan bedrijven levert zoals consultancy, onderzoekssamenwerking, training en rekenkracht. Om de gebruikersbelangen binnen de Vlaamse kennisinstellingen, VWI’s, en SOC’s te behartigen, ging in 2020 het VSC over tot een nieuwe inrichting van de User Council. De zoektocht naar kandidaat-leden verliep via een open oproep. Bij de selectie werd rekening gehouden met de concrete ervaring met HPC in de verschillende facetten (compute, cloud, data/nationaal, EU/ niet-EU, …), en werd er op gelet dat verschillende aspecten uit het werkveld, en wetenschappelijke domeinen aan bod kwamen. Samenstelling vanaf 2020 (aangesteld voor 2 jaren): z Kurt De Grave | Flanders Make z Jan Goedgebeur | UGent z Álvaro Cortés Calabuig | KU Leuven/UZ Leuven Genomics Core z Hans De Winter | UAntwerpen z Jochen Schütz | UHasselt z Catharina Olsen | UZ Brussel z Francisco Tjess Hernandez | VLIZ (voorzitter) z Frederik Coppens | VIB - UGent Center for Plant Systems Biology z Hossein Ghorbanfekr | VITO z Nele Moelans | KU Leuven z Lander Willem | UAntwerpen

Jaarverslag 2020 | vscentrum.be

9

Financiering van het VSC De financiering van de Tier-1 en Tier-2 infrastructuur verloopt momenteel via twee geldstromen. Enerzijds is er een recurrent budget van 6.381.000 euro jaarlijks beschikbaar waarmee voornamelijk Tier-2 investeringen en het personeel gefinancierd worden, aangevuld met co-financiering vanuit de instellingen. Daarnaast wordt via een eenmalige opstartfinanciering van 30.000.000 euro voor de periode 2018-2022 het Tier-1 Supercomputing as a Service met de drie componenten compute, cloud en data gerealiseerd. In 2021 gaat een voorstudie van start aangaande het uitwerken van een langetermijnfinancieringsplan voor de periode 2023-2027.

Recurrente financiering In 2020 werd de Tier-2 infrastructuur voor 6.001.000 euro gecofinancierd door het FWO verdeeld over 4.066.000 euro investeringen in hardware, 1.900.000 euro in personeel en 35.000 euro voor de Belnet verbinding. Daarnaast investeerde het FWO 380.000 euro in het personeel voor de twee Tier-1’s. Het gezamenlijk budget bedraagt dus 6.381.000 euro. Deze middelen werden aangewend voor het financieren van: z personeelskosten voor de exploitatie van Tier-1 (380.000 euro); z personeelskosten voor de opleiding en ondersteuning van gebruikers op zowel Tier-1 als Tier-2 (1.900.000 euro); [Met dit bedrag kunnen aan de vijf Vlaamse universiteiten in totaal het equivalent van 20 VTE’s gesubsidieerd worden.]; z Belnet kosten (35.000 euro); z investeringen en werkingskosten voor de Tier-2 infrastructuur (4.066.000 euro) [De universiteiten hebben deze middelen vooral gebruikt voor bijkomende investeringen in Tier-2. Deze instellingen financieren met eigen middelen de energie- en exploitatiekosten van de Tier-2.] In onderstaande tabel wordt een overzicht gegeven van de verdeling van deze bedragen over de vijf Vlaamse universiteiten. Rubriek Personeel in FTE Totaal personeel CAPEX en werking Tier-2

KU Leuven 6 €570 000 €1 665 434

UHasselt 2 €190 000 €157 354

UGent 5 €475 000 €1 316 977

Subtotaal VUB UAntwerpen Tier-2 3 4 20 €285 000 €380 000 €1 900 000 €418 798 €507 437 €4 066 000

Energiekosten Tier-1 Belnet Totaal

€35 000 €2 270 434

€347 354

€1 791 977

€703 798

€887 437

€35 000 €6 001 000

Tier-1a 2 €190 000

Tier-1b 2 €190 000

€190 000

€190 000

Totaal 24 €2 280 000 €4 066 000 €35 000 €6 381 000

Tabel 1. Verdeling recurrent budget 2019

Voor de toekenning van de subsidies sloot het FWO met elke universiteit een overeenkomst af waarin voorzien werd dat de besteding van de toegekende middelen kan gespreid worden over twee begrotingsjaren. De toegekende middelen moeten met bewijsstukken verantwoord worden en over de aanwending moet er een bestedingsrapport ingediend worden waarin onder meer informatie over het gebruik van de Tier-1 en de Tier-2 infrastructuur gegeven wordt.

10

Jaarverslag 2020 | vscentrum.be

Eenmalige investering SaaS De Tier-1 supercomputing infrastructuur in Vlaanderen was tot nog toe vooral gericht op gebruikers met zware rekenvraagstukken (typische HPC/HTC workloads). Hoewel dit platform in zijn huidige vorm reeds erg succesvol is, komt de huidige focus op compute evenwel niet langer tegemoet aan alle noden van vele onderzoekers. Ook bij de industrie is de vraag naar meer dataverwerking, ontsluiting en gebruiksomgevingen op maat groot. Het VSC biedt daarom een nieuw conceptueel Tier-1 model aan: Supercomputing as a Service (SaaS). Binnen dit model kunnen we verschillende infrastructuurcomponenten onderscheiden, die het samen mogelijk maken om een verhoogd service level aan te bieden aan de gebruikers van het VSC: 1. De belangrijkste component in dit model blijft de compute infrastructuur: klassieke rekenclusters die zware of een veelvoud aan rekentaken kunnen verwerken. 2. Onlosmakelijk daaraan verbonden is een data component. Steeds meer gebruikers hebben immers computationeel werk dat intensief gebruik maakt van grote datasets. Het migreren van deze data van en naar de compute infrastructuur telkens deze voor een berekening moet worden gebruikt, is omwille van de schaal zeer inefficiënt. Het is dan ook noodzakelijk een data component toe te voegen waar grote datasets gedurende een langere tijd kunnen opgeslagen worden en van daaruit ook op een efficiënte manier worden verwerkt.

Afbeelding 2. SaaS

3. Onderzoek met deze datasets vraagt veelal ook een flexibele gebruiksomgeving: een omgeving waar op een interactieve manier, op maat van de toepassingen de gebruikersanalyses kunnen gebeuren; een omgeving waar pre- en postprocessing kan worden uitgevoerd; een omgeving waar de data op een web-gebaseerde manier kan ontsloten worden voor de gebruiker; kan gevisualiseerd worden of kan geraadpleegd worden door medewerkers, geïnteresseerden of gebruikers van het onderzoek of de onderzoeksresultaten.

Jaarverslag 2020 | vscentrum.be

11

Hiertoe wordt een infrastructuur voorzien die niet de focus legt op compute maar eerder op ‘op-maat’ ontsluiting en gebruik van de data. Hier kan een model worden gehanteerd dat sterk aanleunt bij dat van cloud-providers. Een hedendaags Tier-1 supercomputing platform biedt dus zowel compute, data als cloud technologieën complementair met elkaar aan. Toekomstige investeringen in Tier-1 moeten deze focus dan ook reflecteren. Dit houdt in dat blijvende investeringen worden gedaan in de ‘klassieke’ Tier-1 compute infrastructuur, doch dat daarnaast ook een centraal beheerde Tier-1 data omgeving wordt opgebouwd en cloud services worden aangeboden. De laatste twee componenten zijn nieuw op het Tier-1 niveau. Onderstaande impulsfinanciering voor het opbouwen van deze omgevingen zorgt ervoor dat in de periode 2018-2022 een volledig model en infrastructuur kunnen worden uitgebouwd om het Supercomputing as a Service concept te verwezenlijken: 2018 Tier-1 compute

€5 000 000

Tier-1b

€5 000 000

2019

Tier-1 data Stroom en personeel

€ 190 000

Tier-1 stroom Tier-1 personeel

€190 000

Tier-1 integratie Totaal (M)

€5,19

2021

2022

Totaal (M)

€5 022 301

€1 320 500

€6 300 000

€17,6428

€142 780

Tier-1c Tier-1 cloud

2020

€5 022 301

€ 1 177 699

€6 300 000

€360 000

€46 970

€2 140 000

€800 000

€4,9970

€435 000

€475 000

€490 000

€800 000

€2,2000

€ 610 000

€966 294

€1 415 500

€1 465 165

€4,6470

€230 000

€396 294

€845 500

€895 165

€2,3670

€380 000

€570 000

€570 000

€570 000

€2,2800

€45 000

€77 269

€293 000

€ 98 000

€ 0,5133

€1,45

€6,59

€5,66

€11,11

€30,0000

Tabel 2. Details impulsfinanciering

Aangezien de Tier-1 financiering afloopt eind 2022, moeten nu stappen gezet worden voor een vervolgtraject zodat ook na 2022 de toegang tot HPC in Vlaanderen kan gecontinueerd worden. Niet alleen het compute luik, maar ook de data en cloud componenten dienen verder uitgebouwd te worden. Ook de veranderende Vlaamse en internationale context dienen meegenomen te worden in de verdere uitbouw van het VSC.

12

Jaarverslag 2020 | vscentrum.be

COVID-19 In maart opende VSC een speciale COVID-19 oproep voor academisch en industrieel onderzoek. Dit was een onmiddellijk gevolg van de perceptie dat een aantal onderzoeksgroepen al actief bezig waren om de epidemie op verschillende manieren te bestrijden. Verder hadden ook bedrijven baanbrekende ideeën rond het onderwerp. VSC wilde als HPC-centrum deze inspanningen ondersteunen door op een eenvoudige manier toegang tot supercompute resources op de VSC HPC-infrastructuur te verlenen.

Met de hulp van de VSC supercomputers, bieden we tijdige inbreng voor beleidsmakers en volksgezondheidspecialisten om de verspreiding van het virus te bestrijden in Europa” Niel Hens | Biostatisticus | UHasselt/UAntwerpen (Zie pagina 68)

In één van die projecten hebben onderzoekers van de Antwerpse onderzoeksgroep UAMC (University of Antwerp Medicinal Chemistry), onder leiding van professor Hans De Winter, miljoenen chemische structuren op de Vlaamse Supercomputer geëvalueerd. De bedoeling is om tot de beste kandidaat-structuren te komen die de werking van het COVID-virus remmen en klaar te staan met actieve bestanddelen indien er in de toekomst nieuwe uitbraken komen van corona gerelateerde virussen. Dankzij de enorme computerkracht die beschikbaar is bij het VSC konden de kleinste details mee in rekening worden gebracht bij de simulaties. Voor de meest gedetailleerde en meest nauwkeurige settings die werden gesimuleerd, had de Vlaamse Tier-1 supercomputer 1.200 nodedagen nodig per compound, hetgeen overeenkomt met de rekenkracht van meer dan 30.000 gewone desktop computers gedurende een hele dag.

team onder leiding van professor Niel Hens en Lander Willem van de UHasselt en UAntwerpen ontwikkeld, en wordt dus gebruikt om de verspreiding van het COVID-19 virus in België in kaart te brengen en de impact van maatregelen in te schatten. Dit model is de afgelopen periode een heel belangrijk instrument geweest voor het Belgische en Vlaamse coronabeleid. Ook het Rega Instituut aan de KU Leuven geeft aan dat de supercomputer infrastructuur hun toelaat om met genomische analyses de wereldwijde circulatie van SARS-CoV-2 in kaart te brengen. Dit helpt dan ook om de verspreiding van nieuwe varianten te traceren.

Tot slot hebben onderzoekers van de UGentVIB, onder leiding van professor Yvan Saeys, de immuunrespons in de longen en het bloed van gehospitaliseerde COVID-patiënten in kaart gebracht. Op basis van die data kon dan op moleculair niveau bestaande behandelingen geoptimaliseerd worden, of zelfs nieuwe Ook het COVID-19 meta-population model doet geneesmiddelen ontwikkeld. beroep op de rekenkracht van het VSC. Dit metapopulatie model werd door het SIMID COVID-19

Jaarverslag 2020 | vscentrum.be

13

De VSC Infrastructuur Het Tier-1 supercomputerplatform Activiteiten uitgevoerd in 2020 Het Tier-1 SaaS project dat werd opgestart in maart 2018 leverde in 2020 verscheidene resultaten en infrastructuur componenten op, in overeenstemming met het investeringsplan. In 2020 lag de focus op versterking van de compute component enerzijds en anderzijds de verderzetting van de data en cloud piloten. Volgende acties werden in 2020 uitgevoerd voor de verschillende componenten van de Tier-1 SaaS: de aankoopprocedure van het volgende systeem voor de Tier-1 Compute component (Tier-1c) en de eerste fase van de installatie, het verder implementeren van de piloot infrastructuur voor de data component en het identificeren van de gebruikersnoden voor de productieomgeving, de installatie van de infrastructuur voor de productieomgeving van het Tier-1 Cloud component en de migratie van de Cloud piloten naar de nieuwe omgeving. WP0. Management. OMT

WP1. Exploitatie Tier-1b WP16. Aankoop Tier-1c WP17. Installatie Tier-1c

WP4. iRODS piloot WP5. Globus online piloot WP18. Tier-1 Data RFP

WP10. Authenticatie en Autorisatie WP12. VSC network

WP8. OpenStack piloot WP19. Migratie Tier-1 Cloud

WP11. Exploitatie modelen WP20. ISO27001 ISMS WP1/WP2

Afbeelding 3. Tier-1 actieplan

Bovendien werden een aantal taken uitgevoerd rond integratie: de definitie van toegang en exploitatie modellen voor de twee nieuwe componenten (data en cloud), de studie over de mogelijkheden om het VSC Belnet netwerk redundant te maken, en de eerste stappen voor de implementatie van een Information Security Management System (ISMS) framework in het kader van de ISO27001 specificaties.

14

Jaarverslag 2020 | vscentrum.be

Compute Voor de Tier-1 Compute component werden in 2020 de volgende taken uitgevoerd:

Exploitatie Tier-1b (BrENIAC) Er was in 2020 over het algemeen een goede beschikbaarheid van de Tier-1b Compute infrastructuur BrENIAC, met een gemiddelde uptime boven de 96%. Er waren echter ook momenten met een significante downtime: 1) een downtime in augustus om een update van het operating system en de software van het scratch bestandssysteem uit te voeren; 2) een downtime in december toen problemen met enkele slecht werkende InfiniBand kabels er voor zorgden dat de scratch storage instabiel was. Daardoor werd het systeem van 24 december tot 8 januari gesloten. Bovendien waren er ook 2 momenten met gereduceerde bezetting omwille van onderhoudswerken in andere VSC hubs. BrENIAC was weliswaar volledig beschikbaar tijdens deze periodes maar kon tijdelijk niet worden gebruikt door gebruikers van deze hubs: twee downtime periodes van 1 week in Gent begin februari en begin november en een downtime van een week in Antwerpen in de tweede week van februari.

Chart Title

% beschikbare nodes Tier-1

1,2 1100% 0,880% 0,660% 0,440% 0,220% 00% feb

mar

apr

mei

jun

jul

aug

sep

okt

nov

20 20 -0 10 20 20 1 0 0: -0 00 2 -0 20 : 20 1 0 00 0: -0 0 301 0 :0 20 20 00 0 -0 :0 2 0 4-01 0 :0 0 20 -0 0 0: 0 501 0 :0 20 20 00 0 -0 :0 6 20 01 0 :0 0 20 -0 0 0: 0 701 0 :0 20 20 00 0 -0 :0 801 0 :0 0 20 20 00 -0 :0 2 0 9-01 0 :0 0 20 0 0 -1 :0 001 0 :0 20 20 00 0 -1 :0 2 0 1-01 0 :0 0 20 -1 0 0: 0 201 0 :0 00 0 :0 0: 00

jan

dec

Afbeelding 4. Tier-1 Uptime 2020

Jaarverslag 2020 | vscentrum.be

15

Tier-1 bezetting %bezetting 120% 100% 80% 60% 40% 20% 0%

jan

feb

mar

apr

mei

jun

jul

Broadwell

aug

sep

okt

nov

dec

Skylake

Afbeelding 5. Tier-1 bezetting

Installatie Tier-1c (Hortense) In 2020 werd de aankoopprocedure van het volgende systeem voor de Tier-1 compute component (Tier-1c) afgerond. In 2019 werd Universiteit Gent gekozen als hosting site en aanbestedende instelling voor de derde Vlaamse Tier-1 supercomputer. De UGent kondigde op 17 mei 2019 een opdracht aan voor het afsluiten van een raamovereenkomst met het oog op de aankoop, levering en het in bedrijf stellen van Tier-1 HPC rekeninfrastructuur, scratch storage en diensten voor gebruik binnen het VSC. Op deze aankondiging dienden verscheidene leveranciers een aanvraag tot deelneming in. Na een toetsing aan selectiecriteria werden op 1 juli 2019 vervolgens 7 kandidaten geselecteerd en toegelaten om een offerte in te dienen op basis van het bestek. Op 3 januari 2020 werd in een openbare zitting vastgesteld dat 5 leveranciers een offerte hadden ingediend. Na toelichting van deze offertes door alle leveranciers, werd vervolgens op basis van de gunningscriteria in de tussentijdse beslissing van 31 januari 2020 een shortlist van 3 kandidaten opgesteld. Deze kandidaten werden toegelaten tot het volgend stadium van de procedure, met name het indienen van een Best And Final Offer (BAFO). Op 9 maart 2020 werden opnieuw 3 offertes ontvangen. Na andermaal een toelichting van deze aangepaste offertes door de leveranciers werd uiteindelijk op 30 maart 2020 overgegaan tot een finale selectie op basis van de gunningscriteria. Op 22 april 2020 werd de opdracht officieel toegewezen aan ATOS.

16

Jaarverslag 2020 | vscentrum.be

Fun facts over de aanbestedingsprocedure

97

>400

3

+10

+1000

+2300

pagina’s bestek, richtlijnen en technische bijlagen, in 2 talen

meetings van de selectie- en gunningscommissie in 2020

technische specificaties

selectierapporten

email correspondenties gerelateerd aan aanbestedingsgprocedure

pagina’s aan offertes, technische tekeningen en annexen

ATOS zal binnen dit raamcontract twee supercomputers leveren als onderdeel van de Tier-1 Compute component. De tweede fase is gepland voor 2022, de eerste fase werd besteld op 30 april 2020.

3 PB multi-tier storage HDR Infiniband interconnect

294 CPU nodes 37.632 cores 256 GB RAM

42 CPU nodes 5.376 cores 512 GB RAM

20 accelerator nodes 80 GPUs - 40 GB RAM 256 GB RAM

Afbeelding 6. Configuratie van Tier-1c (Hortense)

Jaarverslag 2020 | vscentrum.be

17

De configuratie van deze eerste fase omvat de volgende elementen: z een partitie met 294 nodes, elk uitgerust met twee 64-core AMD Rome 7H12 CPUs en 256 GB RAM z een partitie met 42 nodes, elk uitgerust met twee 64-core AMD Rome 7H12 CPUs en 512 GB RAM z een accelerator partitie met 20 nodes, elk met twee 24-core AMD Rome 7402 CPUs, 256 GB RAM, 4 NVIDIA Ampère A100 GPUs met 40 GB on-board RAM z een multi-tier opslageenheid met ruim 3 PB aan bruikbare opslagruimte met een gedeeld bestandssysteem op basis van Lustre z een InfiniBand HDR100 interconnect tussen alle nodes en opslageenheid In totaal bevat deze cluster dus meer dan 44.000 CPU cores, 80 GPUs en bijna 100 TB aan RAM. Daarmee wordt dit de grootste en snelste supercomputer van Vlaanderen, met een geschatte piekperformantie van 3.3 petaflops. Als naam voor deze Tier-1 Compute component werd gekozen voor “Hortense”. Dat is een verwijzing naar Nicole-Reine Lepaute – Hortense was een bijnaam – die werd geboren in 1723. Zij was één van de eerste notoire menselijke computers (‘calculatrice’), die verscheidene zware astronomische berekeningen uitvoerde. Eén van haar grootste prestaties was een nauwkeuriger voorspelling van de komst van de komeet van Halley. Helaas zegt haar verhaal ook veel over de historische onderwaardering van vrouwen in de wetenschap. Haar belangrijke bijdrage aan het berekenen van de baan van de komeet van Halley werd in de eerste publicatie ‘vergeten’. In de oorspronkelijke planning zou de pilootfase op de Hortense Tier-1 Compute component eind 2020 van start gaan. COVID-19 en dan vooral de reisbeperkingen ter bestrijding van de pandemie hebben evenwel voor ernstige vertragingen gezorgd. Op dit ogenblik is de pilootfase van de Hortense Tier-1 Compute component gepland voor juli-augustus 2021.

Data De Tier-1 data component zorgt ervoor dat onderzoeksdata van VSC gebruikers tijdens de actieve fase van de data levenscyclus dicht bij de Compute en/of Cloud infrastructuur blijft. Tijdens de actieve fase wordt data aangemaakt, gewijzigd, gebruikt en hergebruikt, en dit gedurende de looptijd van het project (typisch 2 tot 4 jaar). Tegelijkertijd wordt het makkelijker om grote datasets van en naar VSC-infrastructuur te migreren. In 2020 lag de focus van de activiteiten voor de Tier-1 data component op de installatie en configuratie van de infrastructuur voor de piloot fase en de opstart van een aantal piloot projecten.

18

Jaarverslag 2020 | vscentrum.be

De Tier-1 data piloot infrastructuur is gebaseerd op de Open Source software iRODS en heeft een storage backend met 2 POSIX systems met een bruto capaciteit van 1,5 PB elk en een object storage systeem (Ceph) met 600 TB bruto capaciteit. Omwille van de COVID-19 pandemie was er een vertraging op de levering van de storage infrastructuur die eind december 2019 werd aangekocht. De werken voor de installatie van deze hardware konden, als gevolg hiervan, pas starten in de loop van april 2020. Na het afwerken van de installatie werd de iRODS middleware software geïnstalleerd, geconfigureerd en getest. Gebruikers krijgen hiermee verschillende user clients tot hun beschikking om met het platform te werken: van basis command line (CLI) en Python clients, die meer geschikt zijn voor gevorderde gebruikers, tot tools zoals Metalnx en YODA die een meer gebruikersvriendelijke Graphical User Interface (GUI) aanbieden.

Users

YODA

Clients

iRODS

DAVRods

iRODS servers

iCAT

iCommands

Mysql Database

Python Client

Rule Engine

Metadata

DC Heverlee

Storage Hardware

DC Leuven

3km Posix Resc1

Ceph Resc3

Posix Resc2 Replica Resc2

Afbeelding 7. De Tier-1 Data piloot infrastructuur

In juni startte het eerste Tier-1 data pilootproject, een samenwerkingsproject tussen 5 onderzoeksgroepen van drie Vlaamse universiteiten (UGent, VUB en KU Leuven) rond klimaatverandering.

Jaarverslag 2020 | vscentrum.be

19

Stage-in

Stage-out

Afbeelding 8. Earth Science data pilot

In juli is een piloot gestart in het kader van het CLARIAH-VL consortium, de Open Humanities Service Infrastructure. CLARIAH-VL is een International Research Infrastructure (IRI) gefinancierd door het FWO die als doel heeft om het gebruik van geavanceerde digitale tools te bevorderen in het domein van humane- en sociale wetenschappen. De piloot zal drie verschillende datasets hosten op de Tier-1 data infrastructuur: oude gedigitaliseerde Belgische kranten, getuigenverklaringen en verhoren van de XVII en XVIII eeuw bewaard bij Belgische rechtbanken en de SONAR dataset, een referentie corpus voor het Nederlands dat 500 miljoen woorden telt. De Tier-1 Compute component zal gebruikt worden om deze datasets te analyseren met “Optical Character Recognition” of “Handwriting Text Recognition” tools en ook tools om m.b.v. machine learning een zogenaamd BERT (Bidirectional Encoder Representations from Transformers) model te trainen voor het Nederlands. In een tweede fase zal de Tier-1 Cloud component een portal hosten om deze datasets publiek beschikbaar te maken en tools aan te bieden voor de analyse van die datasets.

20

Jaarverslag 2020 | vscentrum.be

Datastorage storage used (netto) Tier-1Tier-1 Data used (netto) 2,5

400 350

Size (TB)

250

1,5

200 1

150 100

Number of files (Millions)

2

300

Size (TB) Number of fil es

0,5

50 0

lt1_d_pilot_002

lt1_d_pilot_004

lt1_es2020

0

Afbeelding 9. Tier-1 data storage gebruik

In de laatste maanden van 2020 zijn er twee extra projecten gestart, in een voorbereide fase. Een belangrijke taak van het Tier-1 data team tijdens 2020 was ook de ondersteuning van nieuwe gebruikers. Er werden meerdere trainingsessies georganiseerd om de gebruikers het systeem te leren kennen, er werd trainingmateriaal en gedetailleerde documentatie over het gebruik van de Tier-1 data component beschikbaar gemaakt en er werden in totaal 38 tickets opgelost in het centrale support systeem.

Cloud Onderzoekers die de VSC Tier-1 HPC services gebruiken, hebben ook vaak nood aan meer flexibele gebruikersomgevingen waarin ze kunnen gebruikmaken van software of services die niet geschikt zijn voor gebruik op een grootschalig HPC-systeem zoals op maat softwarepakketten, interactieve data analyses, workflow portals, data visualisatie en specifieke pre- en postprocessing taken. De Tier-1 Cloud component heeft de ambitie om deze nood te lenigen door een Cloud service gebaseerd op OpenStack te implementeren die ‘on demand’ resources zal aanbieden in een meer flexibele en cloud-like manier. De Tier-1 Cloud component biedt Infrastructure as a Service (IaaS) capaciteiten om resources in te zetten zoals virtual machines (VMs), storage of netwerk met volledige controle door de gebruikers van deze resources. In de toekomst zal het ook een aantal high level services aanbieden via een ready-to-use cataloog van templates die het eenvoudig zullen maken om databanken of webservers met slechts een paar muisklikken op te zetten. In 2020 werd hard gewerkt aan een eindtraject om de Tier-1 Cloud component in productie te brengen. Om deze ‘final push’ te verwezenlijken werd bijkomende hulp ingeroepen bij RedHat om het onderliggende OpenStack softwareproduct optimaal in te zetten. Consultancy hiervoor werd aangeleverd door Devoteam.

Jaarverslag 2020 | vscentrum.be

21

De Tier-1 Cloud testomgeving op basis van RedHat OpenStack Platform (RHOSP) v15 bleef immers significante stabiliteitsproblemen opleveren, inherent aan stabiliteitsproblemen in de software versie. In totaal werden hiervoor 70 development issues en bugs bij RedHat gerapporteerd. Pas na een tijdrovende migratie naar RHOSP16.1 (gestart in augustus 2020) kon volwaardige stabiliteit van het platform worden bekomen met behoud van alle features en integraties die in de pilootsetup waren opgenomen. Om de hinder van die migratie voor pilootgebruikers van de Tier-1 Cloud omgeving zo minimaal mogelijk te houden, werd ervoor gekozen om de productieomgeving op te zetten op basis van RHOSP16.1, in parallel aan de bestaande pilootopstelling (op basis van RDO, de niet ondersteunde distributie van OpenStack voor CentOS). Vervolgens werden manueel 7 pilootprojecten gemigreerd naar de nieuwe opstelling, inclusief de reeds aangemaakte images, virtuele storage volumes en publieke IP-adressen. De gebruikers werden uiteraard steeds op de hoogte gehouden, en deze migratie werd ook ruim van tevoren aangekondigd. Tenslotte werd de pilootopstelling (en bijhorende testopstelling voor de pilootomgeving) ontmanteld. In 2020 werd de Tier-1 Cloud infrastructuur op regelmatige wijze gebruikt door de gebruikers binnen de pilootprojecten. Gemiddeld werden 5 VMs gecreëerd per project en die VMs waren actief gemiddeld 5.500 uren per maand, dat is ongeveer het 75% van de tijd. Aantal servers (VMs) 90 80 70 60

Aantal servers (VMs)

50 40 30 20 10 0

2020-01

2020-02

VSC_00002

2020-03

VSC_00003

2020-04

VSC_00005

2020-05

VSC_00006

2020-06 VSC_00007

2020-07 VSC_00008

2020-08

2020-09

VSC_00009

2020-10

VSC_00013

2020-11

VSC_00014

2020-12

VSC_00015

250000

200000

150000

Acteif CPU uren per VM

100000

50000

0

2020-01

2020-02

2020-03

2020-04

2020-05

2020-06

2020-07

2020-08

2020-09

VSC_00002

VSC_00003

VSC_00005

VSC_00006

VSC_00007

VSC_00008

VSC_00009

VSC_00013

VSC_00014

VSC_00015

2020-10

2020-11

2020-12

Afbeelding 10 Gebruik Tier-1 cloud

22

Jaarverslag 2020 | vscentrum.be

In 2020 werden in het algemeen 57 gebruikerstickets aangaande het Tier-1 Cloud platform opgelost via het centrale ondersteuningssysteem. Eén van de pilootprojecten is “Data Cloud for Maritime Industry” van het Vlaams Instituut voor de Zee (VLIZ). In dit project wordt een portal ontwikkeld om verschillende types van maritieme data (fysico-chemical, biodiversity, hydrometeo, acoustic, etc) beschikbaar te maken aan maritieme onderzoekers en professionelen. Dit portal is gehost op de Tier-1 Cloud component en bestaat uit een galerij van “ready to use” producten (bijv. verspreiding en habitatgeschiktheidskaarten voor zeewiersoorten) en een “data explorer” waarmee gebruikers hun eigen of externe datasets kunnen uploaden om ze te analyseren met de Tier-1 Compute infrastructuur. Het platform wordt in 2021 gelanceerd.

Access to ● Data products ● Scripts ● Metadata ● Analytical tools ● Cloud resources

Afbeelding 11. LifeWatch Maritime Industry Data Cloud

Op 10 maart 2020 werd ook een workshop georganiseerd rond proteomics activiteiten in Vlaanderen, specifiek toegespitst op potentiële toepassing in de Tier-1 Cloud. Aan deze workshop namen onderzoeksgroepen deel van UAntwerpen, VUB, UGent, UHasselt en VIB.

Jaarverslag 2020 | vscentrum.be

23

Toekennen van rekentijd Er zijn een aantal manieren waarop onderzoekers rekentijd op Tier-1 Compute component kunnen bekomen. Daarbij wordt een onderscheid gemaakt tussen academische en niet-academische gebruikers. Voor onderzoekers verbonden aan een universiteit, een strategische onderzoeksinstelling (SOC) of een gelijkaardige onderzoeksinstelling bestaan de volgende toegangskanalen:

Starting Grant z Maximaal 500 nodedagen rekentijd z Kan op elk ogenblik aangevraagd worden, met snelle doorlooptijd z Om Tier-1 uit te proberen en benchmarks of softwaretests uit te voeren, als voorbereiding van een volwaardige projectaanvraag z Gratis Er zijn in 2020 in totaal 61 Starting Grants uitgereikt, waarvan 28 in Technologie, 11 in Chemie, 7 in Astronomie en Astrofysica, 6 in Moleculaire Modellering, 3 in Fysica, 2 in Aardwetenschappen, 2 in Wiskunde, 1 in Levenswetenschappen, Chart en 1 in Werktuigkunde. Title

Astronomy and Astronomy andastrophysics astrophysics

13%

Chemistry Chemistry Life sci sciences Life ences

46%

Mathematics Mathematics

20%

Mechanical Engineering Mechanical Engineering

Mol ecularModelling Modelling Molecular 2% 6%

7%

2%

4%

Physics Physics Technology Technology

Afbeelding 12. Verdeling Starting Grants per onderzoeksdomein

24

Jaarverslag 2020 | vscentrum.be

De verdeling per universiteit zag er als volgt uit: UGent: 21, KU Leuven: 18, VUB: 11, UAntwerpen: 2, UHasselt: 2. Verder kregen ook imec (2), MOW (2), SCK CEN (samen met VITO – 1), UCLouvain (1) en het von Karman Instituut (1) Starting Grant(s).

Chart Title

imec imec

18% 2%

3%

KU Leuven KU Leuv en MOW MOW SCK -- vito SCK v ito

30%

3%

UAntwerpen Uantwerpen UCLovainn UCLovai UGent Ugent

34%

UHasselt Uhasselt

3% 3%

2%

2%

VKI VKI VUB VUB

Afbeelding 13. Verdeling Startings Grants per onderzoeksinstelling

In de bijlage is een overzichtslijst te vinden van de aangevraagde Starting Grants in 2020.

Jaarverslag 2020 | vscentrum.be

25

Project access z Voor allocaties van 500 tot 5.000 nodedagen rekentijd z Projectaanvragen beschrijven: } } } } } }

het kaderend wetenschappelijk project; het consortium van gebruikers dat de berekeningen zal uitvoeren; het financierend kanaal; de rekentaken die zullen worden uitgevoerd (technisch); de software die zal worden aangewend; desgevallend, welke wetenschappelijke resultaten werden bekomen met vorige Tier-1 project allocaties. z Projectaanvragen kunnen steeds ingediend worden, maar worden op 3 momenten in het jaar geëvalueerd door de Tier-1 Allocation Board z Gratis Voor het beoordelen van de Tier-1 projectaanvragen werd een ‘Tier-1 Allocation Board’ ingesteld. Hierin zetelen vijf buitenlandse deskundigen: Isabelle Dupays (IDRIS, Frankrijk)

Gavin Pringle (EPCC, UK)

Walter Lioen, voorzitter (SURF)

Nicole Audiffren (CINES, Frankrijk)

Tier-1 Allocation Board Robin Richardson (eSciencecenter, Nederland)

26

Jaarverslag 2020 | vscentrum.be

Het FWO staat in voor het secretariaat. De HPC-coördinatoren van de Vlaamse universiteiten worden als waarnemers uitgenodigd om aan de vergaderingen van de Tier-1 Allocation Board deel te nemen. Bovengenoemde commissie evalueert de aanvragen en beslist of de gevraagde rekentijd geheel, gedeeltelijk of helemaal niet toegekend wordt. In drie ronden zijn er in 2020 in totaal 85 projecten ingediend voor een totaal van 400.203,35 nodedagen. Daarvan werden 77 projecten toegekend voor een totaal van 316.362,4 nodedagen. Net zoals bij HPC clusters in het buitenland zijn chemie, natuurkunde en de ingenieursdomeinen goed vertegenwoordigd.

Astronomy and Astronomy andastrophysics astrophysics

19%

20%

Chemistry Chemistry Computer sciences Computer Science Earth science Earth sciences

14%

15%

Life sci science Life ences

Mol ecularmodelling Modelling Molecular 1% 27%

3%

1%

Physics Physics Technology Technology

Afbeelding 14. Verdeling toegekende projecten in 2020 Tier-1 per wetenschappelijk domein

In de bijlage is een overzichtslijst te vinden van de projecttoekenningen in 2020.

Jaarverslag 2020 | vscentrum.be

27

Voor onderzoekers uit de industrie bestaan eveneens twee toegangskanalen om Tier-1 Compute te bekomen:

Exploratory Access z Maximaal 500 nodedagen rekentijd z Om de Tier-1 gebruikersomgeving uit te proberen, benchmarks of softwaretests uit te voeren z Gratis

Full Access z Bedrijven kunnen een overeenkomst sluiten met de Tier-1 huisvestende instelling en FWO om rekentijd af te nemen z Full cost aanrekening van verbruikte rekentijd en gebruikte storage De tarieven waaraan industriële gebruikers Tier-1 rekentijd kunnen kopen, werden vastgelegd in het Toegangsreglement 2019 en bleven ongewijzigd voor 2020. Daarnaast kunnen onderzoekers uit de industrie ook toegang krijgen tot Tier-1 in het kader van een onderzoeksproject in samenwerking met een publieke onderzoeksinstelling zoals bv. een Vlaamse universiteit.

Exploitatiemodellen voor Tier-1 SaaS platform In 2020 werden ook een aantal aspecten rond integratie verder vorm gegeven. Er werd een voorstel voor de exploitatie- en toegangsmodellen voor Tier-1 data en cloud componenten uitgewerkt. De toegangsmodellen voor data en cloud zullen zoals thans in het Compute model ook via projectaanvragen verlopen met de volgende bepalingen: z Toelatingsvoorwaarden: Dezelfde toelatingsvoorwaarden van Compute zijn ook van toepassing voor data en cloud. Dat is: Publieke Onderzoeksinstellingen kunnen projecten aanvragen, zoals gedefinieerd in het Compute reglement, en commerciële gebruikers kunnen gebruikmaken van kosteloze Exploratory access en betalende Full access. z Looptijd van de projecten: Data projecten zouden een minimale looptijd van acht maanden en van maximaal vier jaar kunnen krijgen. Cloud projecten zouden aangevraagd kunnen worden voor minimum één jaar en maximum twee jaar. Verlengingen met gelijke minimale en maximale looptijden zijn mogelijk via een nieuwe aanvraag. z Evaluatiecommissie: Een evaluatiecommissie wordt ingericht om de data en cloud projecten te evalueren en toe te kennen. Die commissie evalueert de projecten alleen vanuit technisch perspectief en beoordeelt dus, naar analogie met Tier-1 Compute, niet de wetenschappelijke kwaliteit. z Beoordelingskalender: In een eerste instantie zou een beoordelingskalender zoals voor Compute moeten kunnen worden opgezet met drie cut-off momenten per jaar die gealigneerd zullen zijn aan die van Compute. data en cloud Starting Grants aanvragen om testen of het voorbereiden voor een project aanvraag, worden ook opgezet. Deze aanvragen kunnen steeds ingediend worden. Voor commercieel gebruik kunnen zowel de Exploratory Grants aangevraagd als contracten opgesteld worden.

28

Jaarverslag 2020 | vscentrum.be

In de loop van 2021 zullen de nodige reglementen en formulieren voor data en cloud opgesteld worden. Voor de periode 2021 t.e.m. 2022 wordt het free-of-charge model geselecteerd als exploitatiemodel voor academische gebruikers van de Tier-1 cloud en data componenten. Voor commerciële gebruikers wordt het full cost model geselecteerd. Bedrijven kunnen een overeenkomst sluiten met de instelling die de betreffende Tier-1 data en cloud infrastructuur huisvest en het FWO. Bedrijven zouden gratis Exploratory toegang tot cloud en data services (gelimiteerd) kunnen aanvragen. Verder werden in samenwerking met de firma Deloitte de eerste stappen gezet voor de implementatie van een ISMS Framework voor de Tier-1 Compute component waarin de processen en activiteiten werden gealigneerd met de ISO/IEC 27001 standaard. Het doel van de ISMS implementatie is het identificeren, analyseren, evalueren en verminderen van informatie beveiliging risico’s en zo veel mogelijk de kansen en de impact van een cyberveiligheidsincident te reduceren. Tijdens 2020 werden twee werkpakketten van het volledig ISMS traject uitgevoerd. In het Werkpakket 1, ISMS Scope, werd het doel van de VSC ISMS gedefinieerd en beperkt tot de Tier-1 Compute component met de geassocieerde processen en infrastructuur. Daarna werd er in het Werkpakket 2, ISMS Risk Management, een analyse uitgevoerd om een aantal risico’s te identificeren, classificeren en evalueren. Met deze informatie werden de mogelijke acties en controles om ze te verminderen gedefinieerd. Een totaal van 40 risico’s werden geïdentificeerd waarvan slechts 10% als hoge risico’s werden beschouwd. In 2021 zal de ISMS verder uitgevoerd worden met de implementatie van werkpakket 3, ISMS Framework, waarin de processen en procedures van de ISMS zullen ontworpen worden, een aantal KPI zullen gedefinieerd worden en de ISMS policy framework zal geïmplementeerd worden. Ten slotte werd een analyse gemaakt van de mogelijkheden om de connectie voor de KU Leuven en UGent van de VSC Belnet hubs redundant te maken. Deze redundantie zal in de loop van 2021 geïmplementeerd worden.

Jaarverslag 2020 | vscentrum.be

29

Tier-2 infrastructuur In deze sectie wordt een overzicht gegeven van de Tier-2 infrastructuur die binnen de verschillende Vlaamse universiteiten beschikbaar is en wordt het gebruik ervan geïllustreerd.

Tier-2 infrastructuur per instelling f KU Leuven en Universiteit Hasselt Voor de Tier-2 infrastructuur werken de KU Leuven en de UHasselt samen. De infrastructuur bestaat uit: z 2 clusters, 7 partities z 969 TF z 16.556 CPU cores z 78 TB geheugen z 96 GPU devices / 368.640 cuda cores

Afbeelding 15. Tier-2 infrastructuur KU Leuven – UHasselt

30

Jaarverslag 2020 | vscentrum.be

In 2020 is de uitfasering van Thinking begonnen. Deze cluster werd in 2014 voor het eerst in gebruik genomen en later nog uitgebreid. Het oudste deel van Thinking (Ivbridge nodes) werd op 21 april uit dienst genomen. Het meer recente gedeelte van Thinking (Haswell) zal nog een jaar langer in dienst blijven. In 2021 zal Thinking vervangen worden door een nieuwe cluster. Maar omdat al het werk volledig naar Genius zal verhuizen, werd de capaciteit van Genius nog uitgebreid met 24 nodes. Thinking en Genius delen hetzelfde parallel filesysteem (DDN 14K) dat in 2016 in gebruik werd genomen. Eind 2020 is een vervanging voor dit systeem aangekocht. Met een nettocapaciteit van 3PB is het ongeveer 3 keer groter dan het huidige systeem. Hiermee kan een antwoord gegeven worden op de toegenomen data volume vanuit verschillende onderzoeksdomeinen. Het systeem wordt in 2021 in gebruik genomen en zal dus ook geïntegreerd worden met de toekomstige Tier-2 cluster.

f Universiteit Gent UGent investeert reeds sedert meerdere jaren in de uitbouw van een performante infrastructuur. Deze bestaat thans uit: z 7 clusters z 1198 TF z 22.176 CPU cores, 25.600 GPU Tensorcores z 90 TB bruikbaar geheugen Kirlia Cluster IIntel Xeon Gold 6240 (Cascade Lake) 16 node count 36 cores 512 core count 738 GB RAM/node local disk 1.6 TB NVMe HDR100 InfiniBand network GPFS filesystem

Doduo Cluster AMD Epyc 7552 128 node count 96 cores 12288 core count 250 GB RAM/node local disk 180 GB SSD HDR100 network GPFS filesystem

Swalot Cluster Intel Xeon E5-2660v3 (Haswell-EP) 128 node count 20 cores 2560 core count 128 GB RAM/node local disk 1 TB FDR network GPFS filesystem Skitty Cluster Intel Xeon Gold 6140 (Skylake) 72 node count 36 cores 2592 core count 192 GB RAM/node local disk 240 SSD/1 TB EDR network GPFS filesystem

Victini Cluster Intel Xeon Gold 6140 (Skylake) 96 node count 36 cores 3456 core count 96 GB RAM/node local disk 240 SSD/1 TB 10GBE network GPFS filesystem

Joltik Cluster Intel Xeon Gold 6242 (Cascade Lake) 10 node count 32 cores 320 core count 256 GB RAM/node local disk 800 GB SSD double EDR network GPFS filesystem 4 x Volta V100 NVIDIA accelerators (32 GB GPU memory)

Afbeelding 16 Tier-2 infrastructuur UGent Jaarverslag 2020 | vscentrum.be

31

De Tier-2 infrastructuur is opgebouwd uit verschillende clusters, in functie van specifieke kenmerken. In de loop van 2020 werden volgende ingrijpende infrastructuur wijzigingen doorgevoerd: z Cluster golett werd gedecommissioneerd. z GPU cluster joltik werd in productie genomen. z Cluster kirlia werd in productie genomen. Dit is een nieuwe large-memory cluster ter vervanging van cluster phanpy, die begin 2021 uit dienst zal worden genomen. z Snelle scratch arcanine werd in productie genomen. Totale opslag is 70 TB op NVME hardware, bedoeld als ultrasnelle tijdelijke opslag van ‘live’ data voor berekeningen en aangewezen voor I/O intensieve jobs. Arcanine vervangt de phanpy scratch ruimte, die eind 2020 werd uitgefaseerd. z Alle gedeelde bestandssystemen (home, data, scratch) werden gemigreerd naar een nieuw, groter storage volume met een totale opslagcapaciteit van meer dan 3.75 PB. z Nieuwe cluster doduo werd geïntroduceerd in pilootmodus (productie verwacht maart 2021). z De interconnecties van het InfiniBand netwerk, dat de meeste clusters en het gedeelde bestandssysteem onderling verbindt, werden grondig gereviseerd en uitgebreid om de introductie van nieuwe HPC hardware mogelijk te maken.

32

Jaarverslag 2020 | vscentrum.be

f Universiteit Antwerpen Op 31 juli werd de cluster Hopper na 6 jaar dienst uit gebruik genomen en vervangen door Vaughan. Hierdoor nam de rekenkracht met 85% toe, het aantal cores en hoeveelheid geheugen met bijna 50%. De Tier-2 infrastructuur bestaat nu uit de clusters Leibniz en Vaughan: z 440 TF z 11.392 CPU cores, 7.236 accelerator cores (Tesla P100, NEC SX-Aurora TSUBASA 10B en Xeon Phi 7720P) z 52 TB geheugen

Leibniz Cluster Intel Xeon E5-2680v4 (Broadwell) 154 node count 28 cores 4312 core count 146*128 GB RAM/node 8*256 GB RAM/node local disk 120 GB SSD EDR network BeeGFS filesystem 4 NVIDIA Tesla P100 16GB 2 NEC SX-Aurora TSUBASA 10B 1 Xeon Phi 7220P Vaughan Cluster AMD Epyc 7452 (Rome) 152 node count 64 cores 9728 core count 152*256 GB RAM/node local disk 240 GB SSD HDR100 network BeeGFS filesystem

Leibniz Cluster Intel Xeon E5-2680v2 (Ivy Bridge) 24 node count 20 cores 480 core count 24*256 GB RAM/node local disk 500 TB FDR10 network BeeGFS filesystem

Afbeelding 17 Tier-2 infrastructuur UAntwerpen

Jaarverslag 2020 | vscentrum.be

33

f Vrije Universiteit Brussel De Tier-2-infrastructuur aan de Vrije Universiteit Brussel (VUB) ziet er als volgt uit: z 1 cluster / 6 partities z 258 TF z 3.456 CPU cores / 32.256 GPGPU cores z 22,8 TB geheugen Hydra Cluster Intel Xeon E5-2650v4 (Broadwell) 4 node count 24 cores 256 GB RAM/node local disk 2 TB 10GbE network 8 NVIDIA Tesla P100 accelerator

Hydra Cluster Intel Xeon E5-2680v2 (IvyBridge) 37 node count 20 cores 740 core count 17*128 GB RAM/node 20*256 GB RAM/node local disk 900 GB QDR network 12 Tesla K20 NVIDIA accelerator

Hydra Cluster Intel Xeon E7-8891v4 (Broadwell) 1 node count 40 cores 40 core count 1.5 TB RAM/node local disk 4 TB 10GbE network

Hydra Cluster Intel Xeon E5-2680v4 (Broadwell) 27 node count 28 cores 756 core count 256 GB RAM/node local disk 1 TB 10GbE network

Hydra Cluster Intel Xeon Gold 6148 (Skylake) 31 node count 40 cores 960 core count 192 GB RAM/node local disk 1 TB EDR network

Hydra Cluster Intel Xeon E5-2683v4 (Broadwell) 1 node count 32 cores 32 core count 512 GB RAM/node local disk 8 TB 10GbE network 4x GeForce GTX 1080 Ti NVIDIA accelerator

Hydra Cluster Intel Xeon Gold 6148 (Skylake) 22 node count 40 cores 840 core count 192 GB RAM/node local disk 1 TB 10GbE network

Afbeelding 18. Tier-2 infrastructuur VUB

Aan de VUB werd gekozen om uitbreidingen steeds binnen dezelfde Hydra-omgeving te doen, wat efficiënter is voor zowel de gebruikers als het managementteam. Dit heeft dan wel een heterogenere cluster tot gevolg, De cluster beantwoordt op die manier aan specifieke noden van verschillende onderzoeksgroepen.

34

Jaarverslag 2020 | vscentrum.be

Jaarverslag 2020 | vscentrum.be

35

Exploitatie en gebruik Na de beschrijving van de infrastructuur wordt vervolgens een overzicht gegeven van het gebruik van de Tier-1 en de Tier-2. Voor het rapporteren van het gebruik beschikt VSC over een centrale XDMoD infrastructuur die alle data van de verschillende clusters verzamelt en de nodige overzichten genereert. CPU uren Thin clusters Gebruik overnode alle instituten Core-uren CPU uren Thin node clusters

40000000 40000000 35000000 35000000 30000000 30000000 25000000 25000000 20000000 20000000 15000000 10000000 5000000

15000000 10000000 5000000 0

0

jan

feb

Tier-1

mar

apr

mei

jun

jul

aug

KU Leuven/UHasselt UGent Uantwerpen Tier-1 KU Leuven/UHasselt UGent

sep

okt

VUB UAntwerpen Uantwerpen

nov

dec

VUB VUB

Afbeelding 19. Gebruik uitgedrukt in core-uren van alle VSC clusters

Afbeelding 19 geeft het gecumuleerde gebruik weer van de Tier-1 en Tier-2 infrastructuur. Het maandelijks gebruik ligt rond de kaap van 35 miljoen core uren. Dit ligt in dezelfde lijn als de cijfers van 2019. In 2021 wordt terug een stijging verwacht met de komst van de nieuwe Tier-1 en een aantal Tier-2 machines die in 2020 vervangen werden en in 2021 volledig operationeel zullen zijn. Deze grafiek bevat enkel de thin node clusters. In de sectie van de universiteiten zal blijken dat het aantal GPU uren toegenomen is. Deze trend zal zich in de toekomst verder doortrekken met de komst van GPU’s in deGebruikte nieuwe Tier-1. CPU-uren op thin node clusters KU CPU-uren Leuven op & UHasselt Gebruikte thin node clusters KU Leuven & UHasselt

400000 350000 300000 250000 200000 150000 100000 50000 0

jan

feb

mar

thinking haswell genius cascadelake

apr

mei

jun

thinking ivybridge

jul

aug

sep

genius skylake

okt

nov

dec

genius naples

piloot capaciteit

Afbeelding 20. Gebruikte core-uren op de KU Leuven/UHasselt thin node cluster 36

Jaarverslag 2020 | vscentrum.be

Afbeelding 20 Gebruikte core uren op de KU Leuven/UHasselt thin node cluster geeft een overzicht van het gebruik van de infrastructuur aan de KU Leuven. De grafiek stelt het cumulatieve gebruik voor van de verschillende thin node clusters aan de KU Leuven. De Thinking Ivybridge nodes werden uit productie genomen, wat hier duidelijk te zien is. In de zomer had het parallel filesysteem een belangrijke maintenance, waardoor er downtime was op de clusters. Het gebruik van Thinking Haswell neemt langzaam af, alle gebruikers hebben ondertussen hun werk op de Genius cluster opgezet. Thinking Haswell wordt in 2021 uit dienst genomen. Ongeveer 900 gebruikers, gespreid over vele onderzoeksdomeinen hebben gerekend op deze Thin node clusters. Usage of large shared memory nodes

14000 12000 10000 8000 6000 4000 2000 0

jan

feb

mar

apr

mei

Genius superdome core hours

jun

jul

aug

sep

Genius bigmem core hours

okt

nov

dec

Totale capaciteit

Afbeelding 21. Gebruik van shared memory

Buiten de thin node rekencluster zijn er aan de KU Leuven specifieke nodes met meer geheugen, een node met shared memory en nodes met GPU acceleratoren. De Big memory en shared memory nodes gebruiken een hogere memory/core ratio, soms worden niet alle cores in de node gebruikt, maar wel het volledige geheugen. Dus we verwachten hier geen 100% bezetting . De grafiek toont aan dat er een constante bezetting van de big memory nodes is. Voor de shared memory machine Superdome is dit meer variabel, maar de workload die hierop loopt kan niet typisch op andere machines. De hogere geheugen vereisten komen voor bij bepaalde analyses van bioInformatica, scheikunde en ook soms preprocessing werk voor simulaties.

Jaarverslag 2020 | vscentrum.be

37

Genius GPU-uren 2500

2000

1500

1000

500

0

apr

mei

jun

jul

Genius gpu node hours

aug

sep

okt

nov

dec

#

mar

#

feb

#

jan

Totale capaciteit

Afbeelding 22. Gebruik van GPU nodes

De bezetting van de GPU nodes die wordt getoond heeft betrekking op de 96 GPU devices die beschikbaar zijn in de Genius cluster. Het gebruik van de GPU nodes wordt niet op uitgedrukt in CPU uren,UGent omdat dit minder relevant is. Gebruikte core-uren rekenclusters Verdeeld over 22 nodes zijn er 96 GPU devices beschikbaar. Een aantal zijn gereserveerd voor ontwikkeling/debugging. De bezetting van de GPU nodes wordt dan ook als aantal uren dat het GPU device in gebruik is. Meestal zijn dan niet all CPU cores in gebruik. De bezetting van de GPU’s 400000 is het afgelopen jaar hoog geweest. Het aantal onderzoekers die hiervan gebruik maakt is ook stijgend. 350000 300000

Gebruikte core-uren op rekenclusters UGent

250000 400000 200000 150000

350000 300000 250000

golett geolett

jan

feb victini victini

mar

apr swalot swalot

mei skitty skitty

jun

jul phanpy phanpy

aug

sep kirlia kirlia

okt

nov

01 /1 2/ 20 20

01 /1 1/ 20 20

01 /1 0/ 20 20

01 /0 9/ 20 20

01 /0 8/ 20 20

01 /0 7/ 20 20

01 /0 6/ 20 20

0

01 /0 5/ 20 20

50000

01 /0 4/ 20 20

100000

01 /0 1/ 20 20

0

150000

01 /0 3/ 20 20

50000

200000

01 /0 2/ 20 20

100000

dec

joltik joltik

productie capaci teit productie capaciteit

Afbeelding 23. Gebruik van de infrastructuur aan de Universiteit Gent

38

Jaarverslag 2020 | vscentrum.be

Afbeelding 23 geeft het cumulatieve gebruik in 2020 weer van alle rekenclusters in productie aan de Universiteit Gent. In 2020 werden in totaal 86.170.428 core-uren verbruikt op de Tier-2-rekenclusters van de Universiteit Gent. Dit zou overeenkomen met 9.837 jaar rekenwerk op één enkele core. Op de GPU cluster joltik werd in totaal 229.124 aan GPU uren verbruikt. Het gemiddelde effectieve gebruikspercentage bedraagt 73% voor alle clusters met CPU capaciteit in 2020. Voor GPU cluster joltik is het effectieve gebruikspercentage gemiddeld 67%. Deze percentages geven aan hoeveel van het theoretisch beschikbare rekenvermogen in één jaar werd gebruikt (hierbij werd geen rekening gehouden met uitvaltijden, dus de werkelijke waarde is hoger) Gebruikte core-uren op rekenclusters UAntwerpen

300000 250000 200000 150000 100000 50000 0

jan

.

feb

mar

hopper

apr

mei

leibniz

jun

jul

aug

sep

okt

vaughan

nov

dec

Piloot

Afbeelding 24. Gebruik van de infrastructuur van de UAntwerpen

De grafiek van afbeelding 24 stelt het cumulatieve gebruik voor van de clusters Hopper en Leibniz aan de Universiteit Antwerpen. Hopper werd op 1 augustus uit dienst genomen. Vaughan, de opvolger van Hopper, werd in augustus geïnstalleerd. Deze installatie werd gevolgd door een pilootfase waarbij gebruikers uitgenodigd werden. Naast de installatie van een nieuwe cluster in de tweede helft van het jaar, werd in februari een nieuw storage systeem geïnstalleerd, waarbij home/data enerzijds en scratch anderzijds nu volledig gescheiden zijn. De capaciteit op scratch werd ook gevoelig uitgebreid tot meer dan 550 TB. Door stroomstoringen zijn er enkele onderbrekingen geweest in maart, mei en oktober. Ten slotte was er nog een geplande onderbreking om de uitbreiding van Vaughan (januari 2021) voor te bereiden.

Jaarverslag 2020 | vscentrum.be

39

De grafiek in afbeelding 25 stelt in 2020 werden er 3 extra Skylake nodes toegevoegd aan Hydra. Daarnaast werd er een klein virtualisatie systeem toegevoegd om alle management taken op te draaien en werden er dedicated nodes toegevoegd om de NFS export naar de rest van het VSC beter en sneller te laten werken. Het gemiddelde gebruik lag op 71,53%. Er waren geen grote geplande maintenance op Hydra dit jaar: alle updates zijn rollende gedaan. De cluster bleef ten alle tijden online maar telkens werd een deeltje offline gehaald om te updaten. Begin februari is er een netwerk update gedaan die even de cluster onbeschikbaar heeft gemaakt. In het voorjaar waren er ook problemen met het storage systeem waardoor we op een aantal dagen de cluster op pauze hebben gezet. Eind mei waren er werken aan het koelingsysteem waardoor de cluster tijdelijk op lagere capaciteit moest draaien en in augustus hebben we preventief een deel van de cluster uitgezet tijdens de hittegolf. Gebruikte CPU-uren op thin node clusters VUB 90000

80000

70000

60000 Hydra skylake

50000

Hydra ivybridge Hydra broadwell

40000

piloot capaciteit

30000

20000

10000

0

jan

feb

mar

apr

mei

jun

jul

aug

sep

okt

nov

dec

Afbeelding 25. Gebruik van BEGrid cluster aan de VUB

40

Jaarverslag 2020 | vscentrum.be

Naast haar eigen Tier-2-infrastructuur beheert de VUB - samen met de ULB - ook de gridinfrastructuur, die onder meer gebruikt wordt voor het verwerken van de gegevens die worden verzameld bij het uitvoeren van experimenten met de Large Hydron Collider (LHC) aan het CERN, maar ook binnen de Vlaamse onderzoeksgemeenschap gebruikt wordt. De gridinfrastructuur bestaat uit: z 1 cluster z 150 TF z 5.080 CPU cores z 41 TB geheugen Gebruikte core-uren op grid cluster VUBcluster VUB Gebruikte core-uren op grid 300000

250000

200000

Grid

150000

productie capaciteit

100000

50000

0 01/01/20 jan

01/02/20 feb 01/03/20 mar 01/04/20 apr 01/05/20 mei

01/06/20 jun 01/07/20 jul

01/08/20 aug 01/09/20 sep 01/10/20 okt

01/11/20 nov 01/12/20 dec

Afbeelding 26. Grid-infrastructuur VUB

De BEgrid cluster is heterogeen: de cluster bestaat uit verschillende series van workernodes met verschillende generaties van voornamelijk Intel CPU’s. Het doel van de cluster is voornamelijk om data-intensive, single-core berekeningen te doen (zogenaamde High Throughput Computing) en de grote van de cluster wordt uitgedrukt in job slots wat overeenkomt met 1 hyper-threaded CPU core. Het gemiddelde gebruik van de cluster is ongeveer 75%. In 2020 werd de capaciteit van de cluster uitgebreid naar 159 TFlops door 16 workernodes toe te voegen (voor een totaal van 1024 CPU-cores). Deze nieuw nodes zijn uitgerust met een dual AMD

Jaarverslag 2020 | vscentrum.be

41

Epyc 7452 CPU. Er is gekozen om AMD CPU’s te kopen vanwege de uitstekende prijs-performantie verhouding in vergelijking met Intel CPU’s. De capaciteit van het dCache storage systeem is gelijk gebleven op ongeveer 7 PB. Begin februari was er een gepland netwerkonderhoud die enkele uren downtime heeft veroorzaakt. Het traditionele onderhoud in augustus is dit jaar niet doorgegaan. Daarnaast is het batch systeem gemigreerd van Torque naar HTCondor op het einde van augustus zonder downtime (maar wel met verlaagde capaciteit). Er zijn nog een paar dipjes in het gebruik door kleine incidenten: z In juni is er een fileserver gecrasht z In het voorjaar zijn er een paar keer problemen geweest met Torque z In het najaar zijn er een paar dipjes door problemen met HTCondor

Toekennen rekentijd Tier-2 
 Elke universiteit hanteert een eigen procedure voor het toekennen van rekentijd op de Tier-2 infrastructuur en rekent al dan niet een klein deel van de kosten door aan de academische onderzoeker. Voor industriële/externe gebruikers wordt alle verbruikte rekentijd steeds volledig aangerekend. Om toegang te kunnen krijgen tot één van de Tier-2 rekenclusters in de vier VSC hubs (Antwerpen, Brussel, Gent, Leuven) dient de gebruiker over een VSC-userid te beschikken. Die kan worden aangevraagd op https://account.vscentrum.be. Deze website en database centraliseert tevens alle gebruikersinformatie over de instellingen heen over storage quota, lidmaatschap van gebruikersgroepen, virtuele organisaties, etc. 
 De onderzoekers van UAntwerpen en haar associatie hebben volledig vrije toegang tot de Tier2 infrastructuur. Onderzoeksgroepen kunnen wel, op vrijwillige basis, een financiële bijdrage leveren of investeren in bijkomende rekencapaciteit. 
 De onderzoekers van VUB en haar associatie hebben volledig vrije toegang tot de eigen Tier2 infrastructuur. De gridcluster is beschikbaar na aanvraag bij de verantwoordelijke van deze infrastructuur. Het gebruik van de Tier-2 infrastructuur is kosteloos. De onderzoekers van UGent en haar associatie hebben volledig vrije toegang tot de eigen Tier2 infrastructuur. Onderzoeksgroepen kunnen wel, op vrijwillige basis, een financiële bijdrage leveren met als rechtstreekse return-on-invest een (iets) hogere fairshare, of kunnen rekentijd reserveren aan full cost. Op de clusters van KU Leuven/UHasselt wordt gewerkt met een credit accounting systeem dat vervat zit in de scheduling software. Nieuwe gebruikers krijgen rekentijd om vertrouwd te worden met het systeem en om eerste testen uit te voeren. Hiermee is de instapdrempel voor onderzoekers om over te stappen naar de Tier-2 infrastructuur zo laag mogelijk. Vervolgens kunnen credits aangevraagd worden via een eenvoudige procedure en tegen minimale kost. De credits verdelen de beschikbare rekentijd over verschillende projecten en werken responsabiliserend. Bij het uitvoeren van een rekentaak wordt het project aangegeven waarop de credits aangerekend worden. De hoofdonderzoeker is beheerder van het project. Hij kan onderzoekers toegang geven tot de rekentijd en ook de gebruikte rekentijd opvolgen.

42

Jaarverslag 2020 | vscentrum.be

Door gebruik te maken van centrale accounts, kunnen gebruikers ook op andere sites rekenen, rekening houdend met modaliteiten die van toepassing zijn. Hieronder wordt een beknopt overzicht van het cross-site rekenen gegeven. Instelling @KU Leuven/UHasselt @UGent @UAntwerpen @VUB

Compute time in corehours UAntwerpen 5 46 646

VUB

UGent 2 161

145 750 36 94 865

10 875

KU Leuven/UHasselt 8 117 71 965 287 190

Tabel 3. Cross-site rekenen in core-uren

Instelling @KU Leuven/UHasselt @UGent @UAntwerpen @VUB

Compute time in GPUhours UAntwerpen

VUB

9 981 0,0031

12 631

UGent 6 127

KU Leuven/UHasselt

Tabel 4. Cross-site rekenen in GPU-uren

Dit zogenaamde “cross-site” gebruik wordt nauwgezet opgevolgd. Naast het “cross-site” gebruik van Tier-2-infrastructuur, wordt ook de grid-infrastructuur, beheerd door VUB/ULB, intensief gebruikt door onderzoekers van verschillende instellingen: VUB, UAntwerpen en UGent. De overige rekentijd op de grid-infrastructuur wordt gebruikt door onderzoekers van ULB en UCL. De meeste onderzoekers maken gebruik van het zogenaamde “glide in” mechanisme. Hierbij worden “pilot jobs” gesubmit die, eens actief op een worker node, elders de “payload” gaan halen. Voor de berekening van de hierboven vermelde percentages is alleen rekening gehouden met rekentijd van de “pilot jobs”, niet van de individuele “payloads”. Bovendien dient opgemerkt te worden dat bij grid, een workflow van een gebruiker verspreid kan zijn over verschillende sites in verschillende landen en bovenstaande percentages dus maar een deel weergeven van de werkelijk gebruikte rekentijd.

Jaarverslag 2020 | vscentrum.be

43

Gebruikersondersteuning De gebruikersondersteuning bestaat uit verschillende componenten: z het beantwoorden van vragen van gebruikers (helpdesk); 
 z bijeenkomsten met gebruikers / specifieke ondersteuning; 
 z opleiding en outreach. 
 Het laatste punt wordt besproken in secties over “Opleidingen” en “Outreach naar Vlaamse bedrijven”.

Beantwoorden van vragen van gebruikers Hieronder volgt een overzicht van de tickets die bij de helpdesk terechtkomen. Er is geen centrale VSC-helpdesk. Elke instelling beantwoordt de vragen en problemen van de eigen gebruikers (d.w.z. gebruikers die een account hebben aangevraagd in de betrokken instelling), zowel wat betreft de eigen Tier-2 infrastructuur als de centrale Tier-1, maar ook van externe gebruikers die gebruikmaken van de VSC-infrastructuur. Indien nodig wordt voor vragen met betrekking tot de Tier-1 contact opgenomen met de helpdesk aan de KU Leuven. Bij de vragen wordt onderscheid gemaakt tussen 
 Ê vragen over accounts; 
 Ê vragen over software; 
 Ê overige vragen. 
 In onderstaande tabel wordt overzicht gegeven van het aantal behandelde tickets, per categorie en per instelling.

KU Leuven / UHasselt Tier-2 + grid Accounts Software Overig

Tier-1 Accounts Software Overig Totaal

UGent UAntwerpen

1 637 718 450

142 245 1655

122 246 80

125 182 75

7

7

3 187

2 049

455

VUB

327 309 506

1 142

Tabel 5. Behandelde tickets, per categorie en per instelling

44

Jaarverslag 2020 | vscentrum.be

Bijeenkomsten met gebruikers / specifieke ondersteuning Enerzijds wordt geprobeerd zoveel mogelijk onderzoekers te betrekken bij het HPC-verhaal door te kijken of en hoe ze de overstap kunnen maken van hun desktop naar de HPC-infrastructuur of hun eigen desktop gewoon efficiënter kunnen gebruiken. Voor bestaande gebruikers kan dit ook hulp betekenen bij de overstap van Tier-2 naar Tier-1 en eventueel naar Tier-0. Anderzijds wordt geprobeerd om onderzoekers specifieke ondersteuning te geven. Enkele voorbeelden: z optimaliseren van bestaande workflows; 
 z analyse / optimaliseren van code; 
 z input geven aan het schrijven van onderzoeksprojecten. Daarnaast vinden er aan elke instelling nog gebruikersbijeenkomsten plaats waarin een afvaardiging van de gebruikers vertegenwoordigd is. Hier maken we, per instelling, een selectie van de hierboven vermelde ondersteuning.

f KU Leuven en Universiteit Hasselt De VSC-infrastructuur kenbaar maken aan nieuwe onderzoeksgroepen is een blijvend werk. Nieuwe onderzoekers worden vertrouwd gemaakt met het gebruik van de cluster in de reguliere introductiesessies. Omdat het fysieke contact met gebruikers in 2020 is weggevallen werd de standaard introductie cursus opgesplitst in een serie korte video’s. Nieuwe gebruikers kunnen deze gebruiken om gestart te geraken. Telkens er een voldoende grote groep nieuwe gebruikers was, werd een online sessie georganiseerd om alles nogmaals te overlopen. Gebruikers hadden dan ook de mogelijkheid om vragen te stellen. Initiatieven van docenten om bachelor of masterstudenten vertrouwd te maken met de HPC worden actief ondersteund. Er werden sessies georganiseerd voor Bio-Ingenieur studenten en voor studenten Biologie. Ook specifieke studentprojecten kunnen op ondersteuning rekenen. Zo werd het Solar team ondersteund om modellen van hun wagen te berekenen met HPC infrastructuur. Er werd ook de mogelijkheid geboden aan studenten die deelnamen aan de “Datathon” om HPC te gebruiken. Ook contactmomenten voor beginnende ZAP-leden en workshops voor beginnende onderzoekers, bv. bioinformatici werden ondersteund zoals vorige jaren. De dagdagelijkse support behandelt vragen i.v.m. accounts, basisgebruik van de cluster en software-installaties. Het ganse jaar door kon de gewone dienstverlening verder gaan. Alle afspraken met gebruikers werden online georganiseerd. Ook de contacten met industrie partners werden onderhouden en nieuwe contacten konden gelegd worden. Het team in Leuven werkt ook mee aan de VSC projecten in kader van het Tier-1 data platform,

Jaarverslag 2020 | vscentrum.be

45

PRACE 6IP en gaf ondersteuning aan de COVID-19 projecten. Met geïnteresseerde onderzoekers werd een model opgestart waarbij leden van het HPC team diepgaande consultancy kunnen geven aan een onderzoeksgroep. Op deze manier wordt ook de kennis binnen het HPC team versterkt en kunnen best practices met andere groepen gedeeld worden. Voor Universiteit Hasselt lag de klemtoon vooral op het aantrekken van nieuwe gebruikersgroepen en enkele faculteiten kregen bijzondere ondersteuning.

f Universiteit Gent Doorheen het jaar werden verscheidene gebruikersmeetings georganiseerd, in respons op specifieke vragen van onderzoekers en onderzoeksgroepen, o.a.: z Biofluid, Tissue and Solid Mechanics for Medical Applications research group (bioMMeda), UGent z Vakgroep Architectuur en Stedenbouw, UGent z Cancer Research Institute Ghent (CRIG), UGent z VIB Switch Lab, KU Leuven z Vakgroepen Virologie, Parasitologie en Immunologie (faculteit Diergeneeskunde) en Inwendige ziekten en Pediatrie (Faculteit Geneeskunde en Gezondheidswetenschappen), UGent, rond een gemeenschappelijk COVID-project z Research groups Combustion, fire & fire safety & Magnel Laboratory for Concrete Research, UGent z Digital Humanities UGent & Royal Library of Belgium’s Digital Research Lab z Center for Molecular Modeling, UGent z Vakgroep Plant en Gewas (Faculteit Bio-ingenieurswetenschappen) z Sizing Servers Lab, HOWest Om zoveel mogelijk (potentiële) gebruikers te overtuigen van het belang en de meerwaarde van supercomputing werd het VSC en het HPC-UGent team intern voorgesteld: z 26/11/2020, faculteit Wetenschappen (UGent) z 10/12/2020, ICT gebruikerscommissie van de UGent Daarnaast valt op te merken dat het aantal vragen van gebruikers rond dataopslag en -beheer is toegenomen. Hieromtrent werden onder meer verscheidene specifieke acties gevoerd in de faculteit Economie en Bedrijfskunde, UGent: z 7/02/2020: Datastorage@UGent and working with GitHub z 9/11/2020: Datastorage@UGent Theory z 8/12/2020: Datastorage@UGent Applied

46

Jaarverslag 2020 | vscentrum.be

f Universiteit Antwerpen De ondersteuning van de gebruiker staat centraal. We denken hierbij aan tips voor het optimaliseren van workflows of berekeningen en het efficiënt gebruik van de infrastructuur door actieve monitoring van de jobs. Hierbij spelen een goed onderhouden softwarestack en ondersteunende tools een belangrijke rol. Jaarlijks worden ook twee intro-sessies georganiseerd (februari/maart en oktober) die bestaan uit 3 delen: “Linux introduction” (2 halve dagen), “Supercomputers for starters” (1 halve dag) en “HPC@UAntwerp introduction” (2 halve dagen). Door de pandemie werden de laatste twee delen in de herfst online gegeven. De opnames, die per topic opgesplitst worden, staan online. Een maand later werd nog een Q&A sessie voorzien voor onderzoekers die de opnames achteraf bekeken hebben.

Aan de UAntwerpen is sinds 2006 een gebruikersgroep actief die twee keer per jaar samenkomt. De gebruikersgroep bestaat uit afgevaardigden van 13 groepen.

f Vrije Universiteit Brussel Naast het blijven volgen van de bestaande gebruikers op Tier-2 en Tier-1 niveau werd ingezet op het actief identificeren van nieuwe potentiële Tier-1 en Tier-2 gebruikers. Voor de Tier-1 werd ingezet op het stimuleren van een starting grant voor rekentijd. Daarnaast blijven we sterk inzetten op ondersteuning van de gebruikers: de onderzoekers vinden ook steeds makkelijker hun weg naar de HPC ondersteuning voor allerlei vragen. We zijn ook begonnen met actief de gebruikers te contacteren als we merken dat hun jobs niet efficiënt gebruik maken van de cluster. Een bevraging onder de gebruikers leert ons dat men tevreden is over de aangeboden HPC diensten. Er kwamen ook een aantal vragen naar nieuwe functionaliteit voor de cluster. Een aantal van die vragen gaan we proberen op te lossen in 2021.

De “road show” waarbij we met onderzoeksgroepen rond de tafel zitten om het VSC en de infrastructuur en organisatie in Antwerpen toe te lichten, werd in 2020 vervangen door een online variant. Zo hebben we o.a. gesproken met het Centrum voor Medische Genetica. De VUB heeft een HPC-gebruikerscommissie Daarnaast is er de begeleiding van die elk jaar samenkomt, waarin wordt masterstudenten bij het gebruik van teruggekoppeld vanuit het VSC, en die het de infrastructuur, en ondersteuning bij gebruik en de noden voor HPC opvolgt. De de aanvragen voor rekentijd op Tier- gebruikerscommissie omvat leden uit alle 1 en bij computationele aspecten van faculteiten, uit het rekencentrum en vanuit het (interuniversitaire) projectaanvragen. En was er departement onderzoeksbeleid. Qua cursussen ook specifieke ondersteuning voor de COVID-19 worden tweemaal per jaar “Introduction to Linux”, “Introduction to the use of HPC at the projecten VUB” en “Introduction to GRID computing” Ook is er de actieve medewerking binnen georganiseerd. Er werden ook (online) Europese projecten als PRACE en EuroHPC gebruikersmeetings opgezet met specifieke (LUMI en NCC). Zo wordt in het kader van PRACE groepen om hun noden en/of problemen in 6IP gewerkt aan twee projecten met bedrijven. kaart te brengen. Naast de opleidingen binnen het VSC, worden ook cursussen in het reguliere programma verzorgd, nl. “Wetenschappelijke rekenomgevingen” en “(Parallel) programmeren”. 
 Jaarverslag 2020 | vscentrum.be

47

Personeel Gezien de infrastructuur van het VSC (Tier-2 en Tier-1 infrastructuur) geïnstalleerd is in de verschillende universitaire datacentra, is eveneens het personeel tewerkgesteld aan de verschillende universiteiten.

Subsidiëring Enerzijds heeft elke universiteit personeel nodig voor de exploitatie van de Tier-2 infrastructuur en de ondersteuning van de eindgebruikers. Hiervoor worden 20 VTE gesubsidieerd. Anderzijds worden aan de instelling die Tier-1 supercomputer huisvest, VTE toegekend. Hiertoe werden in het verleden 2 VTE toegekend voor de exploitatie van de Tier-1a (UGent) en 2 VTE toegekend voor Tier-1b (KU Leuven). Daarenboven worden voor de uitbreiding van de Tier-1 services 2 VTE ingezet. Dit team staat in voor de concretisering van het Tier-1 project, “Supercomputing as a service”. In 2020 werden, zoals in 2019, binnen dit Tier-1 SaaS project 2 VTE toegewezen aan de domeinen cloud en data. Deze VTE werden toegewezen aan UGent en KU Leuven. Omdat elke universiteit een ander personeelsbeleid voert en verschillende verloningsprincipes hanteert, wordt voor elke VTE een vast bedrag van 95.000 euro uitgekeerd.

Instelling UGent UAntwerpen VUB UHasselt KU Leuven

Aantal gesubsidieerde VTE voor Tier-2 exploitatie en ondersteuning 5 4 3 2,5 6 Tabel 6. Aantal gesubsidieerde VTE voor Tier-2 exploitatie en ondersteuning

Instelling UGent UAntwerpen KU Leuven

Aantal gesubsidieerde VTE voor Tier-1 exploitatie en operationeel management 4,6 0,6 4,6 Tabel 7. Aantal gesubsidieerde VTE voor Tier-1 exploitatie en operationeel management

48

Jaarverslag 2020 | vscentrum.be

Effectieve personeelsinzet Om de verschillende Tier-2 en Tier-1 opstellingen te exploiteren, te onderhouden en om de gebruikers te ondersteunen, is enerzijds meer mankracht nodig dan binnen de subsidiëring voorzien wordt. Anderzijds is een waaier aan expertises nodig die niet binnen één beperkt team opgebouwd kunnen worden. Om hieraan tegemoet te komen, kunnen de HPC-technici en ondersteuners beroep doen op andere experten die werken in de ICT-diensten van de verschillende universiteiten. De universiteiten zetten samen 39,62 VTE in voor de HPC-exploitatie en ondersteuning. Daarnaast doen universiteiten soms ook beroep op externe consultants of jobstudenten voor specifieke taken. Deze worden niet vermeld in de tabellen.

Instelling UGent UAntwerpen* VUB UHasselt KU Leuven Totaal

Aantal VTE ingezet voor HPC 10,4 5,35 5,37 1,5 17 39,62

Aantal koppen betrokken bij de HPC-exploitatie en ondersteuning 15 10 15 2 24 66

Tabel 8. Aantal VTE ingezet en koppen betrokken bij HPC via het VSC

* We merken hierbij op dat, wegens een instellingsbrede regeling, de VTE die aan de Universiteit Antwerpen ingezet worden en die niet ten laste van FWO komen, slechts voor een voorgeschreven en geplafonneerde fractie van de inzet in deze tabel kunnen opgenomen worden.

Jaarverslag 2020 | vscentrum.be

49

Profielen Om een HPC-infrastructuur effectief te exploiteren en te ondersteunen, zijn verschillende ICT-profielen nodig. In grote lijnen gaat het over de volgende profielen:

Infrastructuurbeheerders Deze personen zijn verantwoordelijk voor het inpassen van de HPC-infrastructuur in de datacentra. Zij installeren de infrastructuur in het datacentrum. Ze installeren en beheren eveneens de specifieke storage die aan de HPC gekoppeld is. Daarnaast installeren en beheren ze het interne netwerk van de HPC en koppelen ze de HPC in het universiteitsnetwerk en het intranet. Zij staan in voor de beveiliging van de infrastructuur en de dagelijkse monitoring ervan. Ze werken mee aan de aankoopdossiers rond de integratie van de infrastructuur in het datacentrum.

Systeembeheerders Deze personen staan in voor het installeren en beheren van de basissoftware op de HPC-machines. Dit gaat van het operating systeem tot de scheduling software. Zij staan in voor de dagelijkse monitoring van HPC-systemen. Zij ontwikkelen software voor het efficiënt beheren van de HPCsystemen. Ze werken mee aan de aankoopdossiers rond de architectuur van de HPC-machine en de beheersoftware.

Gebruikersondersteuners Deze personen staan in voor de basisondersteuning van de gebruikers. Ze bemannen de eerstelijnshelpdesk en helpen gebruikers bij hun eerste kennismaking met de machine. Ze installeren de gebruikerssoftware en helpen de gebruikers bij het efficiënt gebruik van de machine. Ze staan in voor de documentatie en geven basisopleidingen.

Wetenschappelijke of gevorderde ondersteuners Deze personen staan in voor het optimaliseren van de gebruikerssoftware op de HPC-machines. Hiervoor werken ze dikwijls een langere tijd samen met één gebruiker en geven gevorderde opleidingen. Deze personen staan ook in voor het bijsturen van de scheduler software zodat die beantwoordt aan de noden van de gebruikers. Ze staan in voor het opzetten van acties met als doel het bewustmaken van de meerwaarde van HPC en het aantrekken van nieuwe gebruikers. Ze werken mee aan de aankoopdossiers rond de user requirements en de benchmarks.

Projectleiders Deze personen hebben de directe leiding over de HPC-teams of leiden grotere HPC- projecten. Ze staan in voor de inbedding van de lokale HPC in de omgeving van het VSC. Ze staan in voor de coördinatie van HPC-initiatieven en gebruikersgroepen binnen de eigen instelling. Ze zijn verantwoordelijk voor de rapportering aan de subsidieverleners. Ze hebben een eindverantwoordelijkheid in aankoopdossiers.

50

Jaarverslag 2020 | vscentrum.be

Outreach

Infrastructuurbeheer

Systeembeheer

Basis gebruikersondersteuning

Wetenschappelijke of gevorderde ondersteuning

Management

Outreach

Heel wat personen die betrokken zijn bij het VSC, spenderen een deel van hun tijd aan het promoten van wetenschappelijk rekenen en HPC. Zij doen dat door infosessies te geven binnen de academische context, maar gaan ook naar de bedrijven. Zij zorgen voor persaandacht of promoten het wetenschappelijk rekenen en VSC op verschillende congressen en andere activiteiten. Daarnaast verzorgen zij de website en zorgen voor materiaal dat op de verschillende events kan worden gebruikt. Het aantal personen die betrokken zijn in de verschillende activiteiten kan u hieronder vinden.

KU Leuven UAntwerpen

6 5

7 3

7 5

6 5

4 3

6 2

UGent UHasselt VUB Totaal

6

8

5 22

3 21

5 1 7 25

5 1 4 21

4 1 4 16

3 1 4 16

Tabel 9. Aantal personen die betrokken zijn per ICT-profiel

Jaarverslag 2020 | vscentrum.be

51

Gevorderde ondersteuning Om gevorderde en wetenschappelijke ondersteuning te kunnen leveren aan de eindgebruikers, is domeinexpertise meestal een pluspunt. Het is echter onmogelijk om binnen elke instelling domeinexpertise op te bouwen voor een breed aantal specifieke gebieden. Daarom is het goed een overzicht te behouden van de verschillende expertises die binnen het VSC aanwezig zijn zodat over de instellingen heen gebruikers beroep kunnen doen op gevorderde expertise wanneer ze deze nodig hebben.

Computational Chemistry 8 personen met wetenschappelijke ervaring in dit domein

Physics 10 personen met wetenschappelijke ervaring in dit domein

Engineering 4 personen met wetenschappelijke ervaring in dit domein

Mathematics (Numerical Methods) 6 personen met wetenschappelijke ervaring in dit domein

Computer science 5 personen met wetenschappelijke ervaring in dit domein

Bioinformatics 3 personen met wetenschappelijke ervaring in dit domein

Humanities 1 persoon met wetenschappelijke ervaring in dit domein

52

Jaarverslag 2020 | vscentrum.be

Outreach naar bedrijven 2020 was ook qua outreach naar bedrijven een bijzonder jaar. Individuele gesprekken met bedrijven moesten opeens online doorgaan, netwerken was plotseling niet meer evident en voor geplande evenementen moest een geheel nieuwe aanpak worden gezocht.

COVID-19 In maart lanceerde VSC een speciale COVID-19 call, en hoewel die voornamelijk op academische onderzoekers was gericht, zijn er ook specifieke contacten naar industrie gemaakt. Concreet bestudeerden een zestal bedrijven hoe ze de VSC infrastructuur/expertise zouden kunnen gaan inzetten in hun COVID-19 onderzoek en toepassingen. Deze zijn: Opal Solutions (Live monitoring of COVID-19 infections & resources in hospitals); ML6 (Model to detect fever based on heat cameras, Google trends data analysis, news item parsing based on NLP); Robovision (Applying AI to detect advanced cases of COVID-19); Yield.io (Model risk management applied to COVID-19); DNAlytics (Data-driven precision medicine); SAVICS (DataToCare COVID-19 tracking system). Dit leidde o.a. tot volgende samenwerking met ML6: https://blog.ml6.eu/dutch-gpt2autoregressive-language-modelling-on-abudget-cff3942dd020.

Jaarverslag 2020 | vscentrum.be

53

Testgebruikers Bedrijven die in de VSC diensten en infrastructuur geïnteresseerd zijn, krijgen de mogelijkheid om tijdens een testfase na te gaan of het aanbod aansluit bij de noden. Nieuwe gebruikers kunnen zo gratis 500 node-dagen krijgen om een proof-of-concept uit te voeren en te verifiëren dat de infrastructuur en dienstverlening geschikt is voor hun applicaties. Bedrijven kunnen daarbij ook rekenen op de ondersteuning van het HPC-personeel. In 2020 startten zo acht nieuwe bedrijven. Het gaat over vier start-ups, drie multinationals, en één KMO. Ze komen uit een verscheidenheid aan sectoren (maritieme sector, maakindustrie, consumentenonderzoek), met als gemene deler dat ze grote hoeveelheden data te verwerken hebben en/of complexe berekeningen doen.

Total # exploratory grants 9 8 7 6 5 4 3 2 1 0

2016

2017

2018

2019

2020

Afbeelding 27. Evolutie van het aantal testprojecten in industrie op Tier-1 Compute

Voor VSC biedt dit verder ook de mogelijkheid om het aanbod naar bedrijven te optimaliseren; om onboarding te vergemakkelijken; en om kennis op te doen rond het soort bedrijven waar VSC de meeste meerwaarde te bieden heeft. In outreach naar bedrijven blijken nieuwe partnerships (zie Partnerships) een positief effect te hebben, plus voorgaande ervaring met de VSC infrastructuur (bv. tijdens doctoraat) speelt ook een belangrijke rol.

54

Jaarverslag 2020 | vscentrum.be

Bestaande en nieuwe klanten Na de testfase is er dan een juridische overeenkomst nodig tussen drie partijen met de exploitant van het Tier-1-systeem (voor BrENIAC bv. is dat KU Leuven) en het Fonds Wetenschappelijk Onderzoek - Vlaanderen (FWO) als juridische entiteiten. Gebruikers worden alleen gefactureerd voor de gebruikte rekentijd en gereserveerde schijfruimte, volgens vaste tarieven. Hoewel het aantal nieuwe klanten in 2020 beperkt bleef, kende de totale rekentijd door de industrie op de VSC Tier-1 infrastructuur ten opzichte van voorgaande jaren een significante stijging. Eén van die nieuwe bedrijven is Mpacts. Zij ontwikkelen simulatiesoftware dat dient om industriële processen met korrelachtige materialen te helpen ontwerpen. Umicore, een wereldwijde groep gespecialiseerd in materiaaltechnologie en recyclage, is al langer klant. Zij maken bv. gebruik van de VSC-infrastructuur om complexe (CFD - computational fluid dynamics) simulaties te maken over hoe innovatieve materialen reageren onder een grote variatie aan omstandigheden.

Total # node days 8000 7000 6000 5000 4000 3000 2000 1000 0

2016

2017

2018

2019

2020

Afbeelding 28. Totaal aantal gebruikte nodedagen op Tier-1 infrastructuur door industrie

Jaarverslag 2020 | vscentrum.be

55

Partnerships In termen van partnerships werd er binnen Vlaanderen in eerste instantie gekeken naar de speerpuntclusters. Een belangrijke samenwerking met de Blauwe Cluster is daaruit al voortgekomen. Dit leidde tot: z Een gezamenlijk event samen met De Blauwe Cluster, VLIZ, en bedrijven: https://www. lifewatch.be/sites/lifewatch.be/files/public/Verslag_LifeWatch_MIAB_25-09-2020_Beknopt.pdf z Een data/cloud pilootproject op de VSC infrastructuur: https://www.blauwecluster.be/ nieuws/ontsluiten-van-mariene-datasets-voor-de-blauwe-economie z En een aantal geïnteresseerde bedrijven Verder werden in de zomer van 2020 alle Vlaamse kandidaat-EDIH’s aangeschreven (https:// www.ewi-vlaanderen.be/nieuws/european-digital-innovation-hubs-vlaamse-preselectie). Uiteindelijk werden hierdoor vier Letters-of-Support (in bijlage) opgemaakt voor volgende projecten: z Artificial Intelligence – trekker: IMEC z EDIH@Agrifood – trekker: ILVO z Energie in de bebouwde omgeving – trekker: Energyville z Smart Cities and Smart Port & Logistics – trekker: The Beacon Flanders Make wordt waarschijnlijk in een later stadium nog toegevoegd. Bedoeling is om via deze EDIH’s de VSC dienstverlening dichter bij organisaties te krijgen.

VSC Industriële raad In 2020 werd de samenstelling van de VSC Industriële raad niet gewijzigd. Mia Vanstraelen (The Brain Group; voorgaand IBM) zat de maandelijkse vergaderingen voor als voorzitter. Overige leden: Benny Westaedt (Van Havermaet), Marc Engels (FlandersMake), Marcus Drosson (Umicore), Sabien Vulsteke (BASF – Agricultural Solutions Belgium), Martine Lewi (J&J), Rudi Lauwereins (imec), en Bart Meert (Agoria). De VSC Industriële raad heeft in 2020 er z’n werk van gemaakt om de noden van de industrie te capteren en over te maken aan de VSC HEC raad.

56

Jaarverslag 2020 | vscentrum.be

Jaarverslag 2020 | vscentrum.be

57

Opleidingen Het VSC besteedt de nodige tijd aan het ondersteunen en opleiden van onderzoekers die gebruikmaken van de infrastructuur. Het is belangrijk dat berekeningen efficiënt uitgevoerd worden om zo de wetenschappelijke competitieve positie van de universiteiten in het internationale onderzoekslandschap te vergroten. Opleidingen door het VSC georganiseerd zijn niet alleen bedoeld voor onderzoekers verbonden aan Vlaamse universiteiten en hun respectievelijke associaties, maar ook voor onderzoekers die werken in de Strategische Onderzoekscentra, de Vlaamse wetenschappelijke onderzoeksinstellingen en de industrie. De opleidingen kunnen worden ondergebracht in vier categorieën die ofwel de vereiste voorkennis aangeven, ofwel verduidelijken dat het om domeinspecifieke onderwerpen gaat: z Introductory z Intermediate z Advanced z Specialist courses & workshops Introductory-cursussen zijn bedoeld voor alle gebruikers van de infrastructuur en worden ten zeerste aanbevolen aan wie nog niet over de nodige vaardigheden beschikt. De plaatselijke VSCmedewerkers leiden deze sessies. Dat biedt onderzoekers ook de kans om kennis te maken met de personen die de vragen beantwoorden die aan de helpdesk worden gesteld. Dat neemt het onpersoonlijke en anonieme karakter van het e-mailverkeer weg. Om de sessies op het intermediate niveau te volgen, zijn de introductory-cursussen als voorkennis vereist. Deze sessies behandelen dan ook specifiekere onderwerpen. De meerderheid van deze cursussen is bedoeld voor gebruikers die zelf software ontwikkelen, hetzij voor

58

Jaarverslag 2020 | vscentrum.be

rekenintensieve toepassingen, hetzij voor pre- en postprocessing van data. Omdat deze opleidingen gespecialiseerder en intensiever zijn dan de introductory-opleidingen, worden ze niet op elke VSC-site gegeven. Gebruikers worden dan ook aangemoedigd de opleidingen op een andere site bij te wonen. Opleidingen op advanced niveau vereisen nog meer ervaring en zijn domeinspecifieker dan de intermediate opleidingen. Voor deze cursussen doet het VSC een beroep op externe lesgevers. Vaak zijn ze verbonden aan PRACE Advanced Training Centers (PATC) of komen ze uit de industrie. In 2020 werden er geen advanced trainingen georganiseerd vanwege de COVID-19 pandemie. Sinds januari 2020 heeft België een PRACE Training Center (PTC), een samenwerking tussen CECI en VSC. In juni organiseerde het VSC een PRACE training in samenwerking met SURFsara (Amsterdam). Deze training werd gegeven door VSC staf die deelnam aan het PRACE train-the-trainer programma. De training werd online georganiseerd. Er waren 28 deelnemers uit diverse Europese landen. De bevraging na afloop toonde zeer lovende beoordelingen. Sommige opleidingen passen in geen van deze drie niveaus: ofwel zijn ze te domeinspecifiek, ofwel omvatten ze het volledige introductory tot advanced niveau. Dit verklaart de term “specialist”, aangezien ook hiervoor vaak beroep gedaan wordt op externe specialisten.

Jaarverslag 2020 | vscentrum.be

59

Door de COVID-19 pandemie werden er in de lente van 2020 nogal wat trainingsessies geschrapt. Geleidelijk aan werd er overgeschakeld op online events, zodat het normale opleidingsaanbod beschikbaar was in de herfst van 2020. Voor een aantal trainingen werd videomateriaal gemaakt dat permanent ter beschikking staat via YouTube. Hoewel het totale aantal trainingsessies en deelnemers lager ligt dan de voorbije jaren merken we dat er een grotere participatie is van deelnemers van buiten de organiserende universiteiten. Het VSC biedt ook opleidingen op maat aan, zowel voor onderzoeksgroepen als voor kennisinstellingen en industrie. Het gaat in dit geval meestal om een standaardopleiding, aangevuld met domeinspecifieke modules die hiervoor speciaal ontwikkeld worden. In 2020 bv. werden trainingen afgenomen door Flanders Make. Een VSC medewerker werkte mee aan

de eerste Artificial Intelligence Data Analysis (AIDA) School for Heliophysicists met sessie over data pipelines en data reduction. Deze school ging door in januari 2020 bij Cineca, Bologna. Een derde en vierde editie van de Massive Online Open Course (MOOC) “Defensive programming en Debugging” die VSC ontwikkelde voor PRACE 5IP (5de Implementation Phase, work package 4) gingen door in de lente en herfst van 2020 en telde 669 en 332 actieve deelnemers uit 131 en 93 landen. Een tweede MOOC “Fortran for scientific programming” is in voorbereiding voor 6IP en zal waarschijnlijk starten in mei 2021.

60

Jaarverslag 2020 | vscentrum.be

In het najaar organiseerde VSC, in samenwerking met IBM, ook een reeks sessies rond Quantum Computing. De ontwikkeling van de quantumcomputer is de laatste jaren in een stroomversnelling geraakt. Voor de klassieke computer is de kleinste informatie-eenheid de bit, die de waarde 0 of 1 heeft. Fysiek kan een bit een elektronisch schakelaartje zijn dat aan of uit staat. Elke moderne chip bevat er miljoenen. De quantumcomputer rekent echter met qubits, die – in een variabele mix – de waarde 0 én 1 hebben. Voor het volledige programma, check: https:// www.vscentrum.be/quantum. Er kwamen meer dan tweehonderd registraties binnen, waarvan ongeveer de helft alle sessies (vier in totaal) bijwoonden. Het publiek bestond voornamelijk uit academici, d.w.z. (doctoraats)studenten, post-docs, proffen aan de Vlaamse universiteiten. Daarnaast namen ook mensen uit het bedrijfsleven en uit overheidsinstellingen deel (+/- 15%). Het VSC participeert sinds september 2020 ook in het EuroCC National Competence Center, onder meer voor het training work package. Hiervoor werd het HPC opleidingsaanbod in België in kaart gebracht. VSC staf kan ook ondersteuning bieden aan docenten die voor reguliere cursussen gebruik willen maken van VSC infrastructuur. In 2020 was dit het geval voor vier cursussen. Uiteraard zijn er ook docenten die hun studenten zelf wegwijs maken. Uiteraard worden de bestaande opleidingen steeds up-to-date gehouden met recente ontwikkelingen, maar er worden ook jaarlijks nieuwe onderwerpen voor training geselecteerd en uitgewerkt. De website van het VSC maakt het opleidingsaanbod bekend, zodat de informatie voor alle geïnteresseerden beschikbaar is. Via interne mailinglists worden de aankondigingen verspreid onder de gebruikers van de infrastructuur. Gerichte mailings vestigen de aandacht op specifieke opleidingen als die nuttig kunnen zijn voor een beperkte doelgroep of voor potentiële gebruikers.

Jaarverslag 2020 | vscentrum.be

61

VSC in de media In 2020 kwam het VSC diverse keren aan bod in de media. Het departement Economie, Wetenschap en Innovatie (EWI) berichtte de pers in oktober over “Hortense”, de nieuwe Tier-1 high performance cluster die geïnstalleerd zal worden in het rekencentrum van de Universiteit Gent. http://departementewi.cmail20.com/t/ViewEmail/r/ DF753F5B91EBD8B02540EF23F30FEDED In dezelfde maand verscheen op de nieuwssite van EWI een overzicht van onderzoek en innovatie in verband met de COVID-19 pandemie. Hierin werd gemeld dat het VSC rekentijd ter beschikking stelt voor onderzoek rond COVID-19, een aanbod waarop gretig ingegaan werd door Vlaamse onderzoekers. https://www.ewi-vlaanderen.be/nieuws/covid-19-eenoverzicht-van-onderzoek-en-innovatie-vlaanderen

62

Jaarverslag 2020 | vscentrum.be

De Blauwe Cluster is een onafhankelijke en neutrale partner die Vlaamse bedrijven ondersteunt bij het opzetten van partnerschappen met andere bedrijven, kenniscentra en overheidsinstellingen met het oog op de ontwikkeling en de bevordering van economische activiteiten op zee. Op hun nieuwssite schreef de Blauwe Cluster over de samenwerking tussen hen, het Vlaams Instituut voor de Zee (VLIZ) en het VSC om datasets te ontsluiten voor bedrijven die actief zijn in deze sector. Dit is één van de pilootprojecten voor data services aangeboden door het VSC. https://www.blauwecluster.be/nieuws/ontsluiten-van-mariene-datasets-voor-de-blauweeconomie Zoals in 2019 droeg het VSC in november bij aan de Dag van de Wetenschap met een podcast getiteld “Hoe werken supercomputers?” Het FWO berichtte hierover op zijn website. https://www.dagvandewetenschap.be/activiteiten/fwo-hoewerken-supercomputers-on-demand

Artificiële intelligentie en machine learning zijn domeinen waarvoor grote hoeveelheden rekenkracht onontbeerlijk zijn. ML6, een team van A.I. experten met kantoren in Gent, Amsterdam, Londen en Berlijn, ontwikkelt zelflerende systemen met toepassingen in diverse sectoren. Het doel is de efficiëntie van hun klanten te helpen verhogen. In een blogpost van december op hun website belichten ze een project waarin een natuurlijk taalmodel voor het Engels aangepast wordt voor het Nederlands. Hiervoor deden ze beroep op de rekeninfrastructuur van het VSC. https://blog.ml6.eu/dutch-gpt2-autoregressive-language-modelling-on-a-budget-cff3942dd020

Jaarverslag 2020 | vscentrum.be

63

Succesverhalen Hierna volgen enkele getuigenissen over het gebruik van supercomputers voor onderzoek, industrie, innovatie en maatschappelijke voordelen. We tonen voorbeelden van hoe universiteiten en bedrijven, private en publieke organisaties supercomputers gebruiken om doorbraken van groot wetenschappelijk of economisch belang te bereiken. Deze prestaties, waarvan vele werden bereikt dankzij toegang tot zeer krachtige supercomputers en HPC-experts bij het Vlaams Supercomputer Centrum, hebben al geruime tijd onderzoekers en bedrijven immense efficiëntie, zowel in werkuren als in euro’s, opgeleverd.

64

Jaarverslag 2020 | vscentrum.be

Jaarverslag 2020 | vscentrum.be

65

Giovanni Lapenta | KU Leuven Prof. Giovanni Lapenta is professor Plasmafysica aan de KU Leuven. Zijn onderzoek heeft Space Weather als onderwerp. Deze discipline probeert stormen - die worden veroorzaakt door zonne-uitbarstingen - en hun impact te voorspellen. Dergelijke simulaties zijn computationeel een grote uitdaging maar bijzonder interessant voor supercomputing.

play v

o ide

66

Jaarverslag 2020 | vscentrum.be

Jaarverslag 2020 | vscentrum.be

67

Supercomputers: One step ahead of CORONA Succesverhaal in februari rond het toen nog nieuwe Coronavirus. Onderzoekers van de Universiteit Hasselt en de Sorbonne Université modelleren hoe interventiestrategieën de verspreiding van het virus in Europa kunnen tegengaan met behulp van onze supercomputers.

68

Jaarverslag 2020 | vscentrum.be

play v

o ide

Jaarverslag 2020 | vscentrum.be

69

Scientific Python @Flanders Make VSC trainde 35 medewerkers @FlandersMake, het Vlaams strategisch onderzoekscentrum voor de maakindustrie. Onderwerp van onze tweedaagse opleiding was Python voor AI.

70

Jaarverslag 2020 | vscentrum.be

play v

o ide Jaarverslag 2020 | vscentrum.be

71

Christophe Verbist | UAntwerpen Met behulp van onze supercomputers bestuderen onderzoekers van de Universiteit Antwerpen de overdracht van informatie in de hersenen en de relatie tussen neuronen en IQ. Bekijk het succesverhaal van Christophe Verbist van het Molecular, Cellular and Network Excitability (MCNE).

play v

o ide

72

Jaarverslag 2020 | vscentrum.be

Sven Rogge | UGent Met behulp van onze supercomputers onderzoekt Sven Rogge van het Fonds Wetenschappelijk Onderzoek - FWO en de Universiteit Gent computationeel nieuwe soorten onconventionele materialen die kunnen worden gebruikt om water uit de woestijnlucht te oogsten, broeikasgassen op te vangen of de impact van mechanische schokken te verminderen.

play v

o ide Jaarverslag 2020 | vscentrum.be

73

Rony Keppens | KU Leuven Een andere VSC Success Story bevat een video-interview met Rony Keppens van de KU Leuven over zijn onderzoek naar zonnefysica. Wat een genoegen om met hem te praten en uit te vinden hoe hij onze supercomputers gebruikt om hoge-resolutiesimulaties te maken.

play v

o ide

74

Jaarverslag 2020 | vscentrum.be

Geoffrey Pourtois | imec “Wat wij waarderen aan het VSC, is de kwaliteit van de infrastructuur en de technische ondersteuning die wij krijgen.” Geoffrey Pourtois van imec deelde met veel plezier zijn verhaal over “atomistische simulaties”, een absolute must see video.

play v

o ide Jaarverslag 2020 | vscentrum.be

75

Success Stories | Benny Westaedt | Van Havermaet Met behulp van onze supercomputers heeft het team van het Vlaams Supercomputer Centrum Van Havermaet geholpen een enorme hoeveelheid documenten te verwerken, een succesverhaal in een specifiek toepassingsgebied voor High-performance computing.

play v

o ide

76

Jaarverslag 2020 | vscentrum.be

Jaarverslag 2020 | vscentrum.be

77

Internationale samenwerking PRACE/LUMI/EuroCC/EuroHPC VSC is ook actief in een aantal Europese projecten. PRACE biedt in Europa ondersteuning om HPC in onderzoek te faciliteren en optimaliseren. Enerzijds is er, via het indienen van projecten, toegang tot Europese supercomputers voor academische en industriële gebruikers. Voorbeeld: onderzoekers van plasma-astrofysica van KU Leuven hebben zo al succesvol verschillende aanvragen ingediend. Anderzijds zijn er de PRACE IP projecten. Daarin wordt b.v. training ontwikkeld en wordt er geavanceerde ondersteuning aan gebruikers aangeboden. De universiteiten van Antwerpen en Leuven zijn de Vlaamse partners in het huidige PRACE 6IP project. EuroHPC bundelt Europese inspanningen om een HPC-ecosysteem van wereldklasse te ontwikkelen. Twee van de EuroHPC projecten waarin ook Vlaanderen betrokken is, zijn LUMI en EuroCC. Ê LUMI is één van de drie pre-exascale supercomputers, gebouwd in Finland, waarin Vlaanderen participeert. De capaciteit die hierdoor beschikbaar komt, opent nieuwe mogelijkheden voor onderzoekers in Vlaanderen. Ê EuroCC is het Nationale Competentie centrum rond HPC. Vlaamse universiteiten werken mee aan elk van de taken en kunnen daarbij rekenen op de steun van FWO. Een van de doelen is om industrie beter te betrekken bij HPC door hun noden goed te begrijpen en in kaart te brengen en hen te ondersteunen waar nodig.

EGI Het VSC is actief aanwezig bij het European Grid Infrastructure-gebeuren (EGI). De VUB grid-cluster is geïntegreerd in de EGI federated e-Infrastructure en door de steun van internationale virtuele organisaties biedt het op deze manier de mogelijkheid aan onderzoekers uit Vlaanderen om deze Europese rekeninfrastructuur te gebruiken. Vooral hoge-energie-fysici van de UAntwerpen, de UGent en de VUB maken hiervan gebruik. Enkele voorbeelden zijn: Ê De grid-cluster ondersteunt de internationale samenwerking “IceCube”. Onderzoekers van de VUB en de UGent zijn hierin actief. Ê De internationale onderzoeksgroep “SoLid”, met onderzoekers van onder meer UGent, UAntwerpen en VUB die neutrino-oscillaties bestudeert op een heel korte afstand van de kern van een reactor in het SCK-CEN te Mol werd opgestart. Deze onderzoeksgroep maakt, met ondersteuning vanuit het VUB-grid-team, gebruik van de EGI grid middleware om op een eenvoudige manier gegevens te delen over de deelnemende universiteiten heen. Ê Daarnaast zijn de projecten WeNMR (NMR spectroscopie), LOFAR (lage frequentie radio astronomie), AUGER (hoge energie komische straling), ARA (neutrino detector op de zuidpool) en RADAR (ook neutrino detector maar via radiogolven) ook een actieve gebruikers van de grid-cluster.

78

Jaarverslag 2020 | vscentrum.be

Jaarverslag 2020 | vscentrum.be

79

Bijlagen | Starting Grants 2020 Naam

Onderzoeker

Instelling

Wetenschapsveld

starter-135 starter-136 starter-137

Yi Ouyang Xavier Deraet Elias Vanden Broeck

UGent UGent UGent

Technology Molecular Modelling Molecular Modelling

starter-138 starter-139 starter-140 starter-141 starter-142 starter-143 starter-144 starter-145 starter-146 starter-148 starter-149 starter-150 starter-151 starter-152 starter-153 starter-154 starter-155 starter-157 starter-158 starter-161 starter-163 starter-164 starter-165 starter-166 starter-167 starter-168 starter-169 starter-170 starter-171 starter-172 starter-173 starter-174 starter-175 starter-176 starter-177 starter-178 starter-179 starter-181 starter-182 starter-183 starter-184 starter-185 starter-186 starter-187 starter-188

Ward Homan Jose Nunez Ares Robin Baeyens Sergiu Clima Kiroubanand Sankaran Yannan Wang Boris Kruljevic Rolando Saniz Pietro Coletti Frank Lenaerts Samuel Neale Thomas Tarnaud Mijie Shi Oña Vera Andrea Carolina Sander Borgmans Lies De Keer Charlotte Titeca Lucas Delcour Yangyang Su Laurent De Moerloose Fan Zhang Eline Louise Desmedt Mesfin Haile Mamme Ruben Van Lommel Mikhail Petrov Prashant Kumar Karen Dorothy Dedecker Jelle Wieme Florian Wery Koen Veys Emerick Guillame Aran Lamaire Wissam Barhdadi Jose Nunez Ares Jan Turek Henri Dolfen Francesco Pucci Piero Ferrari Greeshma Boohalli Shivamallegowda Etienne Paul Hessou Sander Borgmans Santiago Lopez Castano Francois Klein Zuo xiaojing Gerasimos Kolokythas

KU Leuven KU Leuven KU Leuven imec imec UGent UGent UAntwerpen UHasselt SCK - vito UGent UGent KU Leuven UGent UGent UGent KU Leuven UGent VUB UGent KU Leuven VUB VUB VUB UAntwerpen KU Leuven UGent UGent UGent KU Leuven UHasselt UGent UGent KU Leuven VUB UGent KU Leuven KU Leuven VUB VUB UGent MOW UCLovain KU Leuven MOW

Astronomy and astrophysics Technology Astronomy and astrophysics Technology Technology Technology Technology Physics Mathematics Technology Technology Technology Astronomy and astrophysics Technology Molecular Modelling Technology Chemistry Technology Chemistry Technology Astronomy and astrophysics Technology Technology Chemistry Physics Chemistry Molecular Modelling Molecular Modelling Technology Life sciences Technology Molecular Modelling Technology Technology Chemistry Technology Astronomy and astrophysics Chemistry Technology Chemistry Chemistry Technology Earth sciences Technology Technology

80

Jaarverslag 2020 | vscentrum.be

Naam

Onderzoeker

Instelling

Wetenschapsveld

starter-189 starter-190 starter-191 starter-192 starter-193 starter-194 starter-195 starter-197 starter-198 starter-199 starter-204 starter-205 starter-206

Joris Van Bever Ruishen Meng Mats Denanyer Krishna Prasad Ishaan Sood Nicolas Moens Umut Kaya Yang Yang Su Sheng Yang Lilla Kapa Koloszar Flavio Siro Brigiao Xavier Deraet Thijs Bon

VUB KU Leuven VUB KU Leuven KU Leuven KU Leuven UGent KU Leuven UGent VKI VUB VUB KU Leuven

Earth sciences Astronomy and astrophysics Chemistry Astronomy and astrophysics Technology Technology Mathematics Chemistry Physics Technology Technology Chemistry Mechanical Engineering

Jaarverslag 2020 | vscentrum.be

81

Toegekende projecten

82

Naam

Onderzoeker

Instelling

Wetenschapsdomein

2020-01

Rony Keppens

KU Leuven

Astronomy and astrophysics

2020-02

Hans De Winter

UAntwerpen

Life sciences

2020-03

Toon Verstraelen

UGent

Molecular Modelling

2020-04

Veronique Van Speybroeck

UGent

Molecular Modelling

2020-05

Jan Turek

VUB

Chemistry

2020-06

Veronique Van Speybroeck

UGent

Molecular Modelling

2020-07

Veronique Van Speybroeck

UGent

Molecular Modelling

2020-08

Veronique Van Speybroeck

UGent

Molecular Modelling

2020-09

Rony Keppens

KU Leuven

Astronomy and astrophysics

2020-11

Toon Verstraelen

UGent

Molecular Modelling

2020-12

Leen Decin

KU Leuven

Astronomy and astrophysics

2020-13

Veronique Van Speybroeck

UGent

Molecular Modelling

2020-15

Geoffrey Pourtois

imec

Technology

2020-16

Geoffrey Pourtois

imec

Technology

2020-17

Milorad Milosevic

UAntwerpen

Physics

2020-18

Leen Decin

KU Leuven

Astronomy and astrophysics

2020-19

Bart Merci

UGent

Technology

2020-20

Tribhuwan Pandey

UAntwerpen

Physics

2020-22

Rony Keppens

KU Leuven

Astronomy and astrophysics

2020-23

Veronique Van Speybroeck

UGent

Molecular Modelling

2020-24

Robin Baeyens

KU Leuven

Astronomy and astrophysics

2020-25

Veronique Van Speybroeck

UGent

Molecular Modelling

2020-26

Veronique Van Speybroeck

UGent

Molecular Modelling

2020-27

Dirk Lamoen

UAntwerpen

Physics

2020-28

Dirk Lamoen

UAntwerpen

Physics

2020-29

Veronique Van Speybroeck

UGent

Molecular Modelling

2020-30

Frank De Proft

VUB

Chemistry

2020-31

Ken Haenen

UHasselt

Physics

2020-33

Daniel Escudero

KU Leuven

Chemistry

2020-35

Jonas Bekaert

UAntwerpen

Physics

2020-36

Rony Keppens

KU Leuven

Astronomy and astrophysics

2020-37

Frank De Proft

VUB

Chemistry Jaarverslag 2020 | vscentrum.be

Toegekende projecten Naam

Onderzoeker

Instelling

Wetenschapsdomein

2020-38

Jeremy Harvey

KU Leuven

Chemistry

2020-39

Joris Degroote

UGent

Technology

2020-40

Hans De Winter

UAntwerpen

Life sciences

2020-41

Leen Decin

KU Leuven

Astronomy and astrophysics

2020-42

Stefaan Poedts

KU Leuven

Astronomy and astrophysics

2020-44

Veronique Van Speybroeck

UGent

Molecular Modelling

2020-45

Veronique Van Speybroeck

UGent

Molecular Modelling

2020-46

Veronique Van Speybroeck

UGent

Molecular Modelling

2020-47

Kevin Van Geem

UGent

Technology

2020-48

Toon Verstraelen

UGent

Molecular Modelling

2020-49

Frank De Proft

VUB

Chemistry

2020-50

Toon Verstraelen

UGent

Molecular Modelling

2020-51

Francesco Pucci

KU Leuven

Astronomy and astrophysics

2020-52

Milorad Milosevic

UAntwerpen

Physics

2020-53

Mark Saeys

UGent

Chemistry

2020-55

Frederik Tielens

VUB

Chemistry

2020-56

Nicolas Moens and Ileyk El Mellah

KU Leuven

Astronomy and astrophysics

2020-57

Bart Ripperda, Thomas Hertog and Bert Vercnocke

KU Leuven

Astronomy and astrophysics

2020-58

Kenneth Goossens

UAntwerpen

Life sciences

2020-59

Samuel Helsen and Francois Klein

KU Leuven

Earth sciences

2020-60

Santiago Lopez Castano

MOW

Technology

2020-61

Krishna Prasad Sayamanthula and Mijie Shi

KU Leuven

Chemistry

2020-62

Yuhao Zhou and Rony Keppens

KU Leuven

Astronomy and astrophysics

2020-63

Massimo Bocus

UGent

Molecular Modelling

2020-64

Maarten Cools-Ceuppens, Michiel Larmuseau, Michael Sluydts and UGent Toon Verstraelen

Molecular Modelling

2020-65

Pieter Cnudde, Samuel Neale and Veronique Van Speybroeck

UGent

Molecular Modelling

2020-66

Ishaan Sood and Johan Meyers

KU Leuven

Technology

2020-67

Michiel van Setten and Geoffrey Pourtois

imec

Physics

2020-68

Prashant Kumar

KU Leuven

Chemistry

2020-69

Emerick Guillaume

UHasselt

Physics

2020-70

Yi Ouyang and Kevin Van Geem

UGent

Technology

Jaarverslag 2020 | vscentrum.be

83

Toegekende projecten

84

Naam

Onderzoeker

Instelling

Wetenschapsdomein

2020-71

Navaneeth Kodunthirappully Narayanan and Joris Degroote

UGent

Technology

2020-72

Jose Nunez Ares

KU Leuven

Technology

2020-73

Michel Houssa and Ruishen Meng

KU Leuven

Physics

2020-74

Florian Wéry, Laurien Vandewalle and Kevin Van Geem

UGent

Technology

2020-75

Tom Braeckevelt

UGent

Computer Science

2020-76

Lilla Koloszar, Silvania Lopes and Raimondo Giamanco

VKI

Technology

2020-77

Tribhuwan Pandey

UAntwerpen

Physics

2020-78

Alexander Hoffman, Sven Rogge and Veronique Van Speybroeck

UGent

Molecular Modelling

2020-79

Siebe Vanlommel and Veronique Van Speybroeck

UGent

Molecular Modelling

2020-80

Jan Bolte

KU Leuven

Astronomy and astrophysics

2020-81

Sander Vandenhaute and Aran Lamaire

UGent

Molecular Modelling

2020-82

Xiaojing Zuo, Yuri Coutinho and Sourav Chatterjee

KU Leuven

Technology

2020-83

Thobani Gambu, Yaoyuan Zhang, Sara Santos and Cesar Urbina Blanco

UGent

Technology

2020-84

Thobani Gambu, Yaoyuan Zhang, Sara Santos and César A Urbina-Blanco

UGent

Technology

Jaarverslag 2020 | vscentrum.be

Personeelslijst Instelling

Naam

KU Leuven KU Leuven KU Leuven KU Leuven KU Leuven KU Leuven KU Leuven KU Leuven KU Leuven KU Leuven KU Leuven KU Leuven KU Leuven KU Leuven KU Leuven KU Leuven KU Leuven KU Leuven KU Leuven KU Leuven KU Leuven KU Leuven KU Leuven

Herman Moons Leen Van Rentergem Jan Ooghe Jan De Laet Maxime Van den Bossche Mustafa Dikmen Mag Selwa Alexander vapirev Ingrid Barcena Ehsan Moravveji Jo Vandeginste Tom Leuse Yorick Poels Peter veraedt Yuri Moens Rudy Rys Tom van Mierlo Tom Vanhout Yves Daniels Christophe van Buggenhout Sofie Pieraerd Els veraverbeke Philip Brusten

UGent UGent UGent UGent UGent UGent UGent UGent UGent UGent UGent UGent UGent UGent UGent

Wouter Depypere Stijn De Weirdt Alvaro Simon Garcia Andy Georges Kenneth Hoste Ewald Pauwels Balazs Hajgato Kenneth Waegeman Bart Verheyde Danny Schellemans Johan Van Camp Fréderic De Leersnijder Wim Waeyaert Werend Brantegem Dieter Roefs

100,00% 100,00% 100,00% 100,00% 100,00% 100,00% 100,00% 100,00% 100,00% 10,00% 30,00% 20,00% 20,00% 10,00% 50,00%

UHasselt

Geert Jan Bex

100,00%

UHasselt

Rafal al-Takreeti

UAntwerpen UAntwerpen UAntwerpen UAntwerpen UAntwerpen UAntwerpen UAntwerpen UAntwerpen

Franky Backeljauw Stefan Becuwe Kurt Lust Carl Mensch Engelbert Tijskens Annie Cuyt Koen Decauwsemaecker Herwig Kersschot

Jaarverslag 2020 | vscentrum.be

% tewerkstelling in het kader van HPC 20% 30% 100% 100% 100% 100% 100% 100% 100% 100% 100% 50% 100% 100% 100% 40% 100% 20% 50% 50% 10% 10% 10%

50,00% 100,00% 100,00% 100,00% 100,00% 100,00% 5,00% 10,00% 10,00% 85

Personeelslijst Instelling

Naam

UAntwerpen UAntwerpen

Wim Holemans Bertin Peeters

VUB VUB VUB VUB VUB VUB VUB VUB VUB VUB VUB VUB VUB VUB VUB

Samuel Moors Stéphane Gérard Alex Domingo Toro Ward Poelmans Dirk Heyvaert Philippe Leemans Michel Luypaert Olivier Devroede Johan D’Hondt Steven Opstaele Robert Jansen Stefan Weckx Veerle De Rademaeker Nina De Bruyne Henri Vanroelen

86

% tewerkstelling in het kader van HPC 5,00% 5,00% 100,00% 100,00% 100,00% 100,00% 15,00% 25,00% 20,00% 20,00% 15,00% 10,00% 10,00% 10,00% 2,00% 5,00% 5,00%

Jaarverslag 2020 | vscentrum.be

Letter-of-Support EDIH

Jaarverslag 2020 | vscentrum.be

87

Innovative computing for a smarter Flanders

88

Jaarverslag 2020 | vscentrum.be

Colofon Het Vlaams Supercomputer Centrum (VSC) is een virtueel supercomputercentrum voor zowel academici als de industrie. Het wordt door het FWO, in samenwerking met de vijf Vlaamse universitaire associaties, beheerd. Fonds Wetenschappelijk Onderzoek-Vlaanderen Egmontstraat 5 1000 Brussel T 02 512 91 10 info@vscentrum.be www.vscentrum.be Jaarverslag 2020 | vscentrum.be

Verantwoordelijke uitgever dr Hans Willems secretaris-generaal FWO

Copyright Fonds Wetenschappelijk Onderzoek-Vlaanderen

Teksten Leen Van Rentergem, Jan Ooghe, Ingrid Barcena Roig, Annie Cuyt, Stefan Becuwe, Bert Tijskens, Johan Van Camp, Ewald Pauwels, Stijn De Weirdt, Stefan Weckx, Ward Poelmans, Geert Jan Bex, Caroline Volckaert, Tim Jaenen

Creatie en vormgeving Rafal Al-Tekreeti

Uitgegeven in juni 2021 89