97 4 96A+A0(è :`U[LaH IPHéRH
25. Nie tylko RNA. Jaką funkcję pełnią czynniki białkowe niezbędne podczas syntezy białka? 26. Transport przez błonę. Wymień cztery składniki potrzebne do translokacji białka przez błonę retikulum endoplazmatycznego. 27. Pchaj, nie ciągnij! Co jest źródłem energii napędzającej kotranslacyjną translokację przez błonę retikulum endoplazmatycznego?
matycznie przedstawione na rysunku poniżej. W typie 1 grupa aktywująca (oznaczona jako X) jest uwalniana z rosnącego łańcucha. W typie 2 grupa aktywująca jest uwalniana z wprowadzonej jednostki w momencie, gdy zostaje przyłączona do rosnącego łańcucha. Wskaż, która z podanych biosyntez przebiega według typu 1, a która według 2: X
+
28. Patrz uważnie! Bakteryjne mRNA zawierają zazwyczaj wiele kodonów AUG. Jak rybosom wybiera kodon inicjujący syntezę białka? 29. Niby takie same, ale…. Wymień różnice między bakteryjną a eukariotyczną syntezą białka.
X
X
+
X
X
X
typ 1
+
X
+
X
typ 2
(a) synteza glikogenu
30. Jak pies pasterski. Jaka jest rola cząstki rozpoznającej sygnał (SRP) w translokacji białka?
(b) synteza kwasów tłuszczowych
31. Taśma produkcyjna. Dlaczego korzystny jest fakt, że synteza białka zachodzi na polisomach?
(d) synteza DNA
(c) C5oC10oC15 w biosyntezie cholesterolu
32. Połącz właściwie. Skojarz każde określenie z prawej strony z określeniami w części a, b i c.
(e) synteza RNA
(a) Inicjacja
1. GTP
(b) Elongacja
2. AUG
(c) Terminacja
3. fMet
36. Systemy korekcyjne. Porównaj poprawność replikacji DNA, syntezy RNA i syntezy białka. Jakie mechanizmy zapewniają bezbłędność każdego z tych procesów?
4. RRF 5. IF2 6. Shine–Dalgarno 7. EF-Tu 8. peptydylotransferaza 9. UGA 10. transformylaza 33. Zmarnowany wysiłek? Cząsteczki tRNA są całkiem pokaźne, zważywszy, że antykodon składa się tylko z trzech nukleotydów. Jaka jest rola pozostałej części cząsteczki? AHKHUPL a^PǃaHUL a TLJOHUPaTLT YLHRJQP
34. Ewolucyjny dobór aminokwasu. Ornityna jest strukturalnie podobna do lizyny, z tą różnicą, że w łańcuchu bocznym ornityny znajduje się jedna grupa metylenowa mniej niż w lizynie. Próby chemicznej syntezy i izolacji ornitynylo-tRNA zakończyły się niepowodzeniem. Zaproponuj mechanistyczną przyczynę tego niepowodzenia. (Wskazówka: sześcioczłonowe pierścienie są bardziej stabilne niż siedmioczłonowe.) AHKHUPH PU[LNY\QǃJL ^PLKaLJ
35. Różne modele wydłużania łańcucha. Istnieją dwa podstawowe mechanizmy elongacji biocząsteczek, sche-
(f) synteza białka
37. Déja vu. Które z białek w kaskadach białek G odgrywa podobną rolę do roli czynnika elongacyjnego Ts? 38. Rodzinne podobieństwo. Eukariotyczny czynnik elongacyjny 2 (eEF2) ulega zablokowaniu przez ADP-rybozylację, katalizowaną przez toksynę błonicy. Które z innych białek G będą również blokowane w podobny sposób? 39. Wyjątkowa E. coli. W przeciwieństwie do E. coli większość bakterii nie ma pełnej gamy syntetaz aminoacylo-tRNA. Na przykład Helicobacter pylori, wywołujący wrzody żołądka, ma tRNAGln, lecz nie ma syntetazy glutaminylo-tRNA. Glutamina jest jednak częstym aminokwasem w białkach H. pylori. Zasugeruj sposób, w jaki glutamina może być włączana do białek H. pylori. (Podpowiedź: syntetaza Glu-tRNA może błędnie aminoacylować tRNAGln.) 40. Ostatni etap. Jaki element pierwszorzędowej struktury pozwala przenieść informację zawartą w liniowej sekwencji kwasu nukleinowego na trójwymiarową, funkcjonalną strukturę białka? AHKHUPH a^PǃaHUL a PU[LYWYL[HJQǃ KHU`JO
41. Stymulator helikazy. Eukariotyczny czynnik inicjatorowy eIF-4A jest ATP-zależną RNA helikazą. Wyniki badań sugerują, że inny czynnik inicjatorowy eIF-4H towarzyszy w działaniu eIF-4A. Na wykresie (A) przedstawiono dane doświadczalne z badań, w których mierzono aktywność helikazy eIF-4A w obecności eIF-4H.