Z lasami związanych jest wiele rzadkich gatunków roślin i zwierząt. Leśnicy mają tego świadomość, dlatego czynnie włączają się w ich ochronę. Na terenach leśnych występują różne formy ochrony: rezerwaty, parki krajobrazowe, parki narodowe i pomniki przyrody. Szczególną formą ochrony przyrody są obszary Natura 2000.
Są to tereny, na których człowiek może współistnieć z przyrodą. Oznacza to możliwość ingerencji człowieka np. prowadzenia działalności gospodarczej pod warunkiem, że nie zagraża ona gatunkom lub siedliskom, dla ochrony których został wyznaczony taki obszar.
Blisko 40 proc. obszarów Natura 2000 leży na terenach leśnych, dlatego też Lasy Państwowe podejmują określone działania ochronne na rzecz gatunków i siedlisk znajdujących się na obszarach przez nie administrowanych.
