WORKSHOP Utilização do VMD na simulação molecular Nuno M.F. S. A. Cerqueira Carla Teixeira Henrique Fernandes
UCIBIO@REQUIMTE Faculdade de Ciências, Universidade do Porto - Portugal E-mail: nscerque@fc.up.pt Website: http://web.fc.up.pt/pessoas/nscerque
1. Introduction. WebSite : http://web.fc.up.pt/pessoas/nscerque
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
❶ login
username: workshop password: casadasciencias Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
❷
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
2
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
1. Objectivos do Workshop. Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
A utilização dos novos meios tecnológicos de Informação nos planos de actividades educativas tem demonstrado enormes potencialidades a nível pedagógico. O domínio desses meios será, portanto, cada vez mais necessário por parte dos agentes educativos. Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
A realização da acção “O Computador como no ensino da Química” surge da necessidade que os Professores de Físico-Química e Química começam a sentir de saberem tirar o máximo partido das novas tecnologias para a realização de actividades educativas actuais e interessantes que consigam ajudar o aluno na aprendizagem de várias matérias dentro da sala de aula e que o motivem também a desenvolver trabalhos complementares fora da escola. Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
1. Objectivos do Workshop. Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
1
Familiarizar os Professores com os novos meios informáticos aplicados a contextos educativos em Química. Adquirir conhecimentos sobre temas interessantes em Química, através da utilização de meios informáticos. Realização de um projecto educativo que consiga ajudar o aluno na aprendizagem de uma matéria dentro da sala de aula e que o motive também a desenvolver trabalhos complementares fora da escola.
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
2
Equacionar devidamente a interligação entre os problemas da ligação química, da estrutura electrónica e da geometria molecular. Para o efeito, serão utilizados os programas de desenho molecular (BkChem) e de visualização molecular (Avogadro). Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Todos os programas utilizados são de licença livre o que permitirá utilizar os programas na escola e em casa sem qualquer tipo de restrição Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
3
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
2. Modelação Molecular Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
O que é a Modelação Molecular Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
A modelagem molecular envolve a criação, manipulação e/ou representação da estrutura de moléculas bem como o cálculo das propriedades fí sico-químicas a estas associadas. Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Modelos utilizados em modelação molecular são representações simplificadas de objetos e fenómenos fí sicos reais. Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
A modelação molecular consiste assim na construção e manipulação de modelos com objetivo de fornecer uma representação plausível tridimensional de uma determinada molécula, ou moléculas, sob um determinado conjunto de circunstâncias. A parte da química que trata da investigação das estruturas e das propriedades das moléculas é denominada por química computacional. Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
2. Modelação Molecular Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Aplicações da Modelação Molecular Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
1. Estudo da estrutura tridimensional das Moléculas Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Compostos orgânicos
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nano-Tubos Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Compostos inorgânicos
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
DNA/RNA
Proteínas
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Futeboleno
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
2. Modelação Molecular Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Aplicações da Modelação Molecular Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
1. Simulações de dinâmica Molecular Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
2. Modelação Molecular Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Aplicações da Modelação Molecular Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
3. Reacções Químicas
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
2. Modelação Molecular Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Aplicações da Modelação Molecular Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
4. Desenho e Optimização de fármacos Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
3. Softwares Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Avogadro Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Website:
http://avogadro.cc/wiki/Main_Page Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Permite construir modelos moleculares, optimizações de geometria e análise estrutural.
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
VMD
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
http://www.ks.uiuc.edu/Research/vmd/ Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Modelação de moléculas mais complexas Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Nuno M. F. S. A. Cerqueira
Website:
Nuno M. F. S. A. Cerqueira